191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1989 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1904  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
67 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1989  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
67 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0980049  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1974  50S ribosomal protein L35  98.51 
 
 
67 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1881  50S ribosomal protein L35  95.52 
 
 
67 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0627786 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  54.55 
 
 
65 aa  60.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  47.69 
 
 
65 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  52.94 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1609  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
67 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.0147184 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
67 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
67 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
66 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  46.97 
 
 
65 aa  53.9  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5321  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
66 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  44.62 
 
 
65 aa  53.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3042  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 
66 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192095  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0068  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 
66 aa  52  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.5109  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  46.97 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  46.97 
 
 
65 aa  51.6  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1835  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 
66 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0519771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0449  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 
66 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0135  50S ribosomal protein L35  44.29 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1645  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354073  normal  0.121255 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0076  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0128  50S ribosomal protein L35P  51.56 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0134182  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1975  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 
65 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0685  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
67 aa  50.4  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513198  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0218  ribosomal protein L35  50.75 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0230  50S ribosomal protein L35  47.76 
 
 
66 aa  50.1  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 
65 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  48.48 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  44.62 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0450  50S ribosomal protein L35  44.78 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0216  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0040  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  48.48 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  44.62 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1579  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0043  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
66 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0198  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0166  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
66 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.426785  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0673  50S ribosomal protein L35P  45.45 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000162638  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  46.97 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  42.42 
 
 
94 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1192  50S ribosomal protein L35  46.97 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3521  50S ribosomal protein L35P  45.45 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0090517  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 
65 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 
65 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0189  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1450  50S ribosomal protein L35  48.48 
 
 
67 aa  47.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  47.62 
 
 
68 aa  47.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2398  50S ribosomal protein L35  48.48 
 
 
67 aa  47.4  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35653  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1933  ribosomal protein L35  47.62 
 
 
403 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317128  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  42.42 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4614  50S ribosomal protein L35  46.97 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.0110084 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3091  50S ribosomal protein L35  42.42 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.0357819 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2274  50S ribosomal protein L35  46.27 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.5439  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  40.91 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1765  50S ribosomal protein L35  46.27 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  39.39 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  47.69 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  42.42 
 
 
65 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2857  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.20359  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1315  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  43.08 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0411  50S ribosomal protein L35  46.27 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2487  50S ribosomal protein L35  46.27 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499214  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2146  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145013  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  43.08 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_004310  BR2119  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
66 aa  45.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517001  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0470  ribosomal protein L35  42.42 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.835953  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2514  50S ribosomal protein L35  47.76 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2940  50S ribosomal protein L35  46.97 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1302  50S ribosomal protein L35P  42.86 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357951  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1726  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0353101  normal  0.481897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2432  50S ribosomal protein L35  46.97 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342792  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>