163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3091 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3091  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
67 aa  137  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.0357819 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2922  50S ribosomal protein L35  87.88 
 
 
67 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2432  50S ribosomal protein L35  63.64 
 
 
67 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342792  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0685  50S ribosomal protein L35  56.06 
 
 
67 aa  82  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513198  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2940  50S ribosomal protein L35  60.61 
 
 
67 aa  82  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0205  50S ribosomal protein L35  61.19 
 
 
67 aa  80.9  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2514  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 
66 aa  79.7  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2119  50S ribosomal protein L35  59.09 
 
 
66 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517001  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0801  50S ribosomal protein L35  57.58 
 
 
66 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0230  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 
66 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1765  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 
66 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0673  50S ribosomal protein L35P  56.06 
 
 
66 aa  78.2  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0411  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 
66 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2487  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 
66 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499214  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3484  50S ribosomal protein L35  62.69 
 
 
67 aa  77.8  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372856  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2274  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 
66 aa  77.8  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.5439  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4533  50S ribosomal protein L35  61.19 
 
 
67 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2034  hypothetical protein  59.09 
 
 
123 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4268  50S ribosomal protein L35  61.19 
 
 
67 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0450  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 
66 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1933  ribosomal protein L35  54.55 
 
 
403 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317128  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0128  50S ribosomal protein L35P  56.06 
 
 
66 aa  71.2  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0134182  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1192  50S ribosomal protein L35  53.03 
 
 
66 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1315  50S ribosomal protein L35  55.22 
 
 
67 aa  70.9  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0198  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
66 aa  69.3  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0135  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
66 aa  68.2  0.00000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3521  50S ribosomal protein L35P  52.31 
 
 
65 aa  68.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0090517  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5321  50S ribosomal protein L35  57.38 
 
 
66 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  57.38 
 
 
66 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0864  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
68 aa  65.5  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0449  50S ribosomal protein L35  50.82 
 
 
66 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0216  50S ribosomal protein L35  54.1 
 
 
66 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0040  50S ribosomal protein L35  50.82 
 
 
66 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0043  50S ribosomal protein L35  50.82 
 
 
66 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0166  50S ribosomal protein L35  50.82 
 
 
66 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.426785  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0076  50S ribosomal protein L35  50.82 
 
 
66 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0218  ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1609  50S ribosomal protein L35  54.1 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.0147184 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0068  50S ribosomal protein L35  54.1 
 
 
66 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.5109  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1835  50S ribosomal protein L35  51.52 
 
 
66 aa  63.5  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0519771 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3042  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  63.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192095  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0214  ribosomal protein L35  39.39 
 
 
68 aa  53.9  0.0000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0660989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1312  ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  53.9  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000103845  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf193  50S ribosomal protein L35  49.18 
 
 
62 aa  52  0.000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000550484  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2155  50S ribosomal protein L35  48.48 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000190573  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  43.75 
 
 
65 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1313  50S ribosomal protein L35  42.42 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.711955  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  43.75 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  44.44 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  42.31 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2857  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.20359  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  42.62 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4614  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.0110084 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3181  50S ribosomal protein L35  40.98 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340502  normal  0.163577 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  46.03 
 
 
73 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 
65 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 
65 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1989  50S ribosomal protein L35  42.42 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0980049  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1904  50S ribosomal protein L35  42.42 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  45 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 
65 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  43.08 
 
 
67 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101932 
 
 
-
 
NC_002936  DET0751  50S ribosomal protein L35  34.33 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000137261  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1753  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  43.08 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  38.33 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  38.33 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  36.92 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18511  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.752965  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1881  50S ribosomal protein L35  40.91 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0627786 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  38.46 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1974  50S ribosomal protein L35  40.91 
 
 
67 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
81 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0189  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  34.38 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2398  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35653  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  36.92 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>