More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3521 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3521  50S ribosomal protein L35P  100 
 
 		 65 aa  131  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0090517  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0801  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 		 66 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2034  hypothetical protein  56.92 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2119  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 66 aa  77  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517001  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0673  50S ribosomal protein L35P  57.81 
 
 		 66 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0685  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 67 aa  75.1  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513198  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2274  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 66 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.5439  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1765  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2487  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0411  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0198  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 66 aa  70.1  0.000000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  53.12 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0135  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 66 aa  69.3  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2922  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3091  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.0357819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2432  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0230  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 66 aa  66.6  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2940  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 67 aa  64.3  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1192  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0218  ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0450  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3484  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4268  50S ribosomal protein L35  46.97 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4533  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 67 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1315  50S ribosomal protein L35  48.48 
 
 		 67 aa  62  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2514  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  44.62 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0205  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 		 67 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf193  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 		 62 aa  60.1  0.000000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000550484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1933  ribosomal protein L35  50 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317128  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  47.62 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  40.62 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2155  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000190573  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  40 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5321  50S ribosomal protein L35  51.52 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  44.62 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  43.75 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  51.52 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1312  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000103845  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  46.77 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  45.31 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0864  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  36.92 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0128  50S ribosomal protein L35P  46.15 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0134182  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1835  50S ribosomal protein L35  46.97 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0519771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1579  50S ribosomal protein L35  44.62 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  46.55 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1801  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00132404  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  43.55 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  40 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  46.67 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0767  ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  45.31 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0751  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 67 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000137261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6086  50S ribosomal protein L35P  48.15 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0449  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1609  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.0147184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>