220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0673 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0673  50S ribosomal protein L35P  100 
 
 		 66 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2119  50S ribosomal protein L35  77.27 
 
 		 66 aa  106  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517001  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2034  hypothetical protein  77.27 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0801  50S ribosomal protein L35  75.76 
 
 		 66 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0230  50S ribosomal protein L35  73.85 
 
 		 66 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2514  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 66 aa  99  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2274  50S ribosomal protein L35  73.85 
 
 		 66 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.5439  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0450  50S ribosomal protein L35  73.44 
 
 		 66 aa  98.2  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1765  50S ribosomal protein L35  73.85 
 
 		 66 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3484  50S ribosomal protein L35  70.15 
 
 		 67 aa  97.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0411  50S ribosomal protein L35  73.85 
 
 		 66 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2487  50S ribosomal protein L35  73.85 
 
 		 66 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4268  50S ribosomal protein L35  68.66 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4533  50S ribosomal protein L35  68.66 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1315  50S ribosomal protein L35  67.16 
 
 		 67 aa  96.7  8e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0205  50S ribosomal protein L35  67.16 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0198  50S ribosomal protein L35  63.08 
 
 		 66 aa  86.3  1e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0135  50S ribosomal protein L35  63.08 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0218  ribosomal protein L35  60.61 
 
 		 66 aa  84  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0685  50S ribosomal protein L35  57.58 
 
 		 67 aa  83.2  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513198  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2922  50S ribosomal protein L35  60.61 
 
 		 67 aa  82.4  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0128  50S ribosomal protein L35P  62.12 
 
 		 66 aa  81.6  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0134182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2432  50S ribosomal protein L35  59.09 
 
 		 67 aa  80.1  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1192  50S ribosomal protein L35  56.06 
 
 		 66 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0864  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 68 aa  78.2  0.00000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3091  50S ribosomal protein L35  56.06 
 
 		 67 aa  78.2  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.0357819 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3521  50S ribosomal protein L35P  57.81 
 
 		 65 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0090517  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2940  50S ribosomal protein L35  56.06 
 
 		 67 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1835  50S ribosomal protein L35  63.08 
 
 		 66 aa  76.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0519771 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3042  50S ribosomal protein L35  63.08 
 
 		 66 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1609  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 67 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.0147184 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 67 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 67 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5321  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 67 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0068  50S ribosomal protein L35  62.69 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.5109  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0449  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 66 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0076  50S ribosomal protein L35  63.08 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1933  ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 403 aa  71.6  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317128  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0216  50S ribosomal protein L35  62.12 
 
 		 66 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0043  50S ribosomal protein L35  61.19 
 
 		 66 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0166  50S ribosomal protein L35  61.19 
 
 		 66 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.426785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0040  50S ribosomal protein L35  59.7 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0214  ribosomal protein L35  48.48 
 
 		 68 aa  67.8  0.00000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0660989  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2155  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 66 aa  60.1  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000190573  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  49.21 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  44.62 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  43.75 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  44.62 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  40 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1312  ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000103845  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  40 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 		 65 aa  50.8  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  37.1 
 
 		 64 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  37.1 
 
 		 64 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1904  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1881  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0627786 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1974  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1989  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0980049  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 64 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2857  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  40.32 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  45.31 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  37.5 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4614  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.0110084 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  46.67 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  47.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  41.54 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101932 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1645  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354073  normal  0.121255 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1975  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>