More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1881 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
65 aa  129  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  69.23 
 
 
65 aa  97.4  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  69.23 
 
 
65 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 
66 aa  88.2  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1477  50S ribosomal protein L35  64.62 
 
 
65 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.570064  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2607  50S ribosomal protein L35  70.15 
 
 
67 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3499  50S ribosomal protein L35  70.15 
 
 
67 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145508  normal  0.184731 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 
65 aa  84  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 
65 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 
65 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 
65 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 
65 aa  80.5  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18511  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 
65 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.428259  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18701  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 
65 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.951627  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 
65 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4254  50S ribosomal protein L35  65.67 
 
 
67 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18511  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 
65 aa  77.8  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.752965  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  58.46 
 
 
65 aa  76.6  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1753  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 
65 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  53.85 
 
 
65 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 
65 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 
65 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
65 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 
65 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  57.63 
 
 
65 aa  70.1  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 
64 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  56.25 
 
 
64 aa  68.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 
65 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 
65 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  68.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 
65 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0488  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
65 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000885309  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0982  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0841883 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 
64 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  45.31 
 
 
65 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 
65 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 
65 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 
79 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1579  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1645  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354073  normal  0.121255 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00825  ribosomal protein L35  54.84 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.381879  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  48.44 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1975  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  51.61 
 
 
64 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  62  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 
65 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 
65 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  46.88 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  46.77 
 
 
66 aa  61.6  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 
65 aa  61.6  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  61.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05600  ribosomal protein L35  60.38 
 
 
57 aa  61.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612539  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2301  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
65 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000837102  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  51.61 
 
 
64 aa  60.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  43.08 
 
 
65 aa  60.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1556  ribosomal protein L35  51.67 
 
 
69 aa  60.5  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.637628  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1343  ribosomal protein L35  55.17 
 
 
65 aa  60.5  0.000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000164157  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  51.61 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0994  50S ribosomal protein L35  55.93 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1998  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0506186  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  45.31 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  45.31 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101932 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
66 aa  58.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
66 aa  58.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  46.77 
 
 
64 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  58.2  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0170  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00827937  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
81 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  45.31 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  53.23 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  45.31 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0751  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
67 aa  57.4  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000137261  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  48.39 
 
 
64 aa  57.8  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>