268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4254 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4254  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 67 aa  133  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3499  50S ribosomal protein L35  83.58 
 
 		 67 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145508  normal  0.184731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2607  50S ribosomal protein L35  83.58 
 
 		 67 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  71.64 
 
 		 65 aa  91.3  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  70.15 
 
 		 65 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  68.18 
 
 		 66 aa  80.9  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1477  50S ribosomal protein L35  67.16 
 
 		 65 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.570064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  65.67 
 
 		 65 aa  78.2  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  65.15 
 
 		 65 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  65.15 
 
 		 65 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  62.12 
 
 		 65 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  59.09 
 
 		 65 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  63.64 
 
 		 65 aa  74.7  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18511  50S ribosomal protein L35  60.61 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.428259  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18701  50S ribosomal protein L35  60.61 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.951627  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  59.09 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1753  50S ribosomal protein L35  60.61 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18511  50S ribosomal protein L35  59.09 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.752965  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  61.19 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 64 aa  62  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  56.25 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  50.75 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  54.55 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3327  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797164  normal  0.341501 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  48.48 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  51.52 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  50.75 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  50 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  51.52 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1556  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 69 aa  57  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.637628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  43.94 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0982  50S ribosomal protein L35  53.03 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0841883 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  53.03 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1343  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000164157  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11659  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1318  ribosomal protein L35  43.94 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.35652  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1998  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0506186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  43.28 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  45.59 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0751  50S ribosomal protein L35  48.48 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000137261  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  51.52 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  46.97 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1579  50S ribosomal protein L35  46.97 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2980  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415069  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2995  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138749  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3024  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.584231 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  47.76 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  47.76 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  44.78 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  49.25 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2417  ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  47.76 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1975  50S ribosomal protein L35  46.97 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  46.15 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1645  50S ribosomal protein L35  46.97 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354073  normal  0.121255 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  46.27 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_657  ribosomal protein L35  46.97 
 
 		 67 aa  53.5  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000644452  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  50.75 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  46.27 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  43.08 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2301  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000837102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  44.78 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  49.25 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  49.25 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  49.25 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  49.25 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  44.78 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  45.45 
 
 		 67 aa  52  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101932 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  49.25 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  46.97 
 
 		 65 aa  52  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  49.25 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  46.97 
 
 		 65 aa  52  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>