More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_00601 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 65 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  95.38 
 
 		 65 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  95.38 
 
 		 65 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  90.77 
 
 		 65 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18701  50S ribosomal protein L35  87.69 
 
 		 65 aa  117  7e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.951627  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18511  50S ribosomal protein L35  87.69 
 
 		 65 aa  117  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.428259  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18511  50S ribosomal protein L35  86.15 
 
 		 65 aa  115  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.752965  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1753  50S ribosomal protein L35  84.62 
 
 		 65 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  84.62 
 
 		 65 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  83.08 
 
 		 65 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  71.88 
 
 		 65 aa  96.7  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  70.31 
 
 		 65 aa  94.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1477  50S ribosomal protein L35  70.31 
 
 		 65 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.570064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 65 aa  80.9  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  60 
 
 		 66 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2607  50S ribosomal protein L35  63.64 
 
 		 67 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3499  50S ribosomal protein L35  63.64 
 
 		 67 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145508  normal  0.184731 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4254  50S ribosomal protein L35  63.64 
 
 		 67 aa  74.7  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 66 aa  67  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  54.69 
 
 		 65 aa  67  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 68 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0982  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0841883 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1556  ribosomal protein L35  52.46 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.637628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1975  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1318  ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.35652  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1645  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354073  normal  0.121255 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  47.69 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101932 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1579  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2051  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0770661  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2182  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0779373  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1890  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  48.44 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1343  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000164157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1714  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406642  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1822  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000837501  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000162638  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2623  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1726  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0353101  normal  0.481897 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  46.77 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  44.62 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>