270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1477 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1477  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
65 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.570064  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 
65 aa  101  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  73.85 
 
 
65 aa  97.4  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  73.44 
 
 
65 aa  94.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  68.75 
 
 
65 aa  91.3  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  67.19 
 
 
65 aa  88.2  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  70.31 
 
 
65 aa  87.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  70.31 
 
 
65 aa  87.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  70.31 
 
 
65 aa  87.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  64.62 
 
 
65 aa  86.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  65.62 
 
 
66 aa  85.5  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1753  50S ribosomal protein L35  64.06 
 
 
65 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3499  50S ribosomal protein L35  67.16 
 
 
67 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145508  normal  0.184731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2607  50S ribosomal protein L35  67.16 
 
 
67 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18511  50S ribosomal protein L35  64.06 
 
 
65 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.752965  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18701  50S ribosomal protein L35  64.06 
 
 
65 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.951627  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18511  50S ribosomal protein L35  64.06 
 
 
65 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.428259  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4254  50S ribosomal protein L35  67.16 
 
 
67 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 
65 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 
65 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
64 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0488  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
65 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000885309  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0982  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0841883 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  52.31 
 
 
65 aa  67.4  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  53.23 
 
 
64 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11659  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
64 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  47.69 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  53.12 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2980  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
64 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415069  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3024  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
64 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.584231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2995  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
64 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138749  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 
65 aa  63.5  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  63.9  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3327  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
64 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797164  normal  0.341501 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  63.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  50 
 
 
71 aa  62.8  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
64 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  62.8  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  48.44 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  52.31 
 
 
65 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  46.15 
 
 
65 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1556  ribosomal protein L35  51.67 
 
 
69 aa  61.6  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.637628  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  60.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  43.08 
 
 
65 aa  61.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 
65 aa  61.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  48.39 
 
 
64 aa  60.5  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  46.77 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  50 
 
 
64 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  44.62 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  45.31 
 
 
79 aa  58.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  45.31 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2146  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145013  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  58.2  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000162638  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  46.88 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  44.62 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  57.4  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  48.39 
 
 
64 aa  57.4  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_002936  DET0751  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
67 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000137261  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
65 aa  57.4  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 
65 aa  57.4  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2051  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  57  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0770661  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
64 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  57  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0535  ribosomal protein L35  40.91 
 
 
66 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000240133  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1726  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  57  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0353101  normal  0.481897 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  46.77 
 
 
63 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 
65 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 
65 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 
65 aa  56.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01686  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0100016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1925  ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359648  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0679  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000758197  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2435  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000580293  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1915  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414534  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1463  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.3269  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1446  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109072  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1474  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0002542  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1890  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1798  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000060614  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  46.88 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_657  ribosomal protein L35  43.75 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000644452  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1430  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000901433  normal  0.0165189 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1838  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121921  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2010  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.800044 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1959  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000143205  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01675  hypothetical protein  46.88 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  39.06 
 
 
65 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>