277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0982 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0982  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 65 aa  130  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0841883 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  90.77 
 
 		 65 aa  120  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  80 
 
 		 65 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0488  50S ribosomal protein L35  85.71 
 
 		 65 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000885309  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 65 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  53.85 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1556  ribosomal protein L35  55.74 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.637628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1477  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.570064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  67  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 66 aa  67  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2146  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000162638  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1318  ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 64 aa  64.3  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.35652  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1726  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0353101  normal  0.481897 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  53.97 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  53.12 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01686  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0100016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1925  ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359648  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3042  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173164  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1798  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000060614  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0154  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1430  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000901433  normal  0.0165189 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  62  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1463  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.3269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1474  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0002542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1959  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000143205  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01675  hypothetical protein  53.85 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0162765  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1838  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121921  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2010  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.800044 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2051  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0770661  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1915  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414534  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2435  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000580293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  48.44 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1446  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1890  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2182  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0779373  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1822  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000837501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1714  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406642  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2503  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2623  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0189  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0165  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1579  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1645  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354073  normal  0.121255 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1975  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18701  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.951627  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18511  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.428259  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2301  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2016  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000210298  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1753  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1957  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  normal  0.347549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2019  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101706  normal  0.0487659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2045  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000199534  hitchhiker  0.00708309 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1767  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852967  normal  0.0187188 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18511  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.752965  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0121  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.379431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1713  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.971881  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0429  ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0170  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00827937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1707  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0213276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>