More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0994 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0994  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 65 aa  122  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  79.69 
 
 		 65 aa  100  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  69.23 
 
 		 65 aa  85.5  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  70.97 
 
 		 64 aa  83.6  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00825  ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  80.1  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.381879  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  65.62 
 
 		 64 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  60.94 
 
 		 64 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  65.52 
 
 		 64 aa  73.9  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  62.9 
 
 		 65 aa  73.9  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  59.7 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  70.1  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  60 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  56.92 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20440  50S ribosomal protein L35  60 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.836721  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  58.33 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2380  ribosomal protein L35  58.46 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2164  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000105441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  50.77 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1933  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000771602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  55.93 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3479  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0370445  normal  0.0138501 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2467  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3223  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  56.9 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1969  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00375988  hitchhiker  0.00635162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2506  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684912  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28670  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000017021 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  61.11 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  58.06 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1978  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378736  normal  0.0703875 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  60.1  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2301  50S ribosomal protein L35  60.34 
 
 		 65 aa  60.1  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000837102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0488  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000885309  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0982  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0841883 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2146  50S ribosomal protein L35  62.07 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2398  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1450  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4614  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.0110084 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1839  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2104  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365417  normal  0.232505 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  50.79 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0429  ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1872  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2852  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0103934 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2059  ribosomal protein L35  56.67 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.617937  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1677  ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0163169  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  44.62 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1998  50S ribosomal protein L35  56.9 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0506186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0114  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0241  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3499  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145508  normal  0.184731 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0269  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  51.72 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>