More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2155 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2155  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 66 aa  129  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000190573  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5321  50S ribosomal protein L35  46.97 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0189  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  46.97 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 67 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 67 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1609  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.0147184 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2503  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0411  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2119  50S ribosomal protein L35  51.52 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517001  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2487  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1765  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4533  50S ribosomal protein L35  51.52 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0205  50S ribosomal protein L35  51.52 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2274  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.5439  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0218  ribosomal protein L35  44.62 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0068  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.5109  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0801  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2034  hypothetical protein  51.52 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1835  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0519771 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3042  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0673  50S ribosomal protein L35P  47.69 
 
 		 66 aa  60.1  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3484  50S ribosomal protein L35  48.48 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4268  50S ribosomal protein L35  48.48 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  49.23 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1315  50S ribosomal protein L35  48.48 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0121  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.379431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1713  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.971881  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0154  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  48.48 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0198  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  46.97 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0216  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0135  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3521  50S ribosomal protein L35P  43.94 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0090517  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0982  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0841883 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  53.7 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  46.15 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  43.94 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0174  50S ribosomal protein L35  56 
 
 		 64 aa  57  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  51.85 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0230  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0043  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0166  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.426785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1933  ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 403 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317128  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  50 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  46.97 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  44.62 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0449  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  49.09 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0076  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2940  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  50 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6086  50S ribosomal protein L35P  48.15 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  50 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  44.62 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1318  ribosomal protein L35  51.52 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.35652  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0488  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000885309  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0165  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0040  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>