235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0189 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0189  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 66 aa  129  2.0000000000000002e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  55.74 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2155  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000190573  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0982  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0841883 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  56.45 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0488  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000885309  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1890  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1714  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406642  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2623  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1822  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000837501  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2182  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0779373  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2051  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0770661  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2261  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000246297  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2220  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2186  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000722256  normal  0.0355999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2328  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000825235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2146  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 65 aa  52  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2122  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000215801  normal  0.0294636 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1726  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0353101  normal  0.481897 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2150  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000191739  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01686  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0100016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1925  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1798  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000060614  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2435  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000580293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1915  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414534  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2010  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.800044 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1463  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.3269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1474  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0002542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1838  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121921  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1446  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1430  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000901433  normal  0.0165189 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1959  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000143205  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2030  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  51.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000722543  hitchhiker  0.0000219314 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01675  hypothetical protein  46.77 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0162765  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1318  ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.35652  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2016  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000210298  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  56.45 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1313  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.711955  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  41.27 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1767  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852967  normal  0.0187188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2489  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000637036  hitchhiker  0.0000746157 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003714  LSU ribosomal protein L35p  47.62 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000181829  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1707  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0213276  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2026  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0783263  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02081  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2301  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 64 aa  50.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1957  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 64 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  normal  0.347549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2019  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 64 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101706  normal  0.0487659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2045  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 64 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000199534  hitchhiker  0.00708309 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1556  ribosomal protein L35  50 
 
 		 69 aa  50.4  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.637628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1975  50S ribosomal protein L35  41.27 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1765  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3042  50S ribosomal protein L35  52.46 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173164  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2487  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1645  50S ribosomal protein L35  41.27 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354073  normal  0.121255 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0411  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  41.27 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  41.27 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  41.27 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  45.16 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  41.27 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  41.27 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>