233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1713 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1713  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 64 aa  128  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.971881  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0154  50S ribosomal protein L35  89.06 
 
 		 64 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0174  50S ribosomal protein L35  85.94 
 
 		 64 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0121  50S ribosomal protein L35  87.3 
 
 		 65 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.379431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2503  50S ribosomal protein L35  83.87 
 
 		 64 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0165  50S ribosomal protein L35  83.87 
 
 		 64 aa  107  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0170  50S ribosomal protein L35  79.03 
 
 		 64 aa  103  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00827937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0429  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 68 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  48.39 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3327  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797164  normal  0.341501 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2155  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000190573  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0982  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0841883 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  46.77 
 
 		 63 aa  57  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  57  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  46.77 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  45.16 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3042  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173164  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  46.77 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1302  50S ribosomal protein L35P  43.55 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357951  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2980  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415069  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3024  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.584231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2995  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138749  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3181  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340502  normal  0.163577 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11659  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  49.21 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0535  ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000240133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  42.86 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  48.28 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0488  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000885309  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25680  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  43.55 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0114  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3053  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6086  50S ribosomal protein L35P  52 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1883  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0659918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  50.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>