More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0489 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  100 
 
 		 65 aa  130  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1579  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 		 65 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 81 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  100  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  100  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  100  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  100  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1645  50S ribosomal protein L35  73.85 
 
 		 65 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354073  normal  0.121255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1975  50S ribosomal protein L35  73.85 
 
 		 65 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  72.31 
 
 		 65 aa  97.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  70.77 
 
 		 65 aa  97.1  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2398  50S ribosomal protein L35  73.85 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  70.77 
 
 		 65 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  72.31 
 
 		 65 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1450  50S ribosomal protein L35  73.85 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2852  50S ribosomal protein L35  74.6 
 
 		 67 aa  94  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0103934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1777  50S ribosomal protein L35  75.81 
 
 		 62 aa  94  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.786581 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4614  50S ribosomal protein L35  70.77 
 
 		 67 aa  93.2  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.0110084 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1872  ribosomal protein L35  74.6 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  69.23 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  73.02 
 
 		 73 aa  92  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2857  50S ribosomal protein L35  69.23 
 
 		 67 aa  92  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2104  50S ribosomal protein L35  71.43 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365417  normal  0.232505 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  66.15 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101932 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3091  ribosomal protein L35  67.69 
 
 		 67 aa  87.4  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.848097  normal  0.0845178 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0831  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 		 65 aa  86.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.227484  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  64.62 
 
 		 65 aa  79.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 65 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2318  50S ribosomal protein L35  67.74 
 
 		 65 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144382  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  61.9 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  57.81 
 
 		 65 aa  73.9  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2380  ribosomal protein L35  66.13 
 
 		 64 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2164  50S ribosomal protein L35  66.13 
 
 		 64 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000105441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1933  50S ribosomal protein L35  66.13 
 
 		 64 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000771602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1318  ribosomal protein L35  58.46 
 
 		 64 aa  72.4  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.35652  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02081  50S ribosomal protein L35  60 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003714  LSU ribosomal protein L35p  60 
 
 		 64 aa  70.1  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000181829  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2467  50S ribosomal protein L35  64.52 
 
 		 64 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3223  50S ribosomal protein L35  64.52 
 
 		 64 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3479  50S ribosomal protein L35  64.52 
 
 		 64 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0370445  normal  0.0138501 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2301  50S ribosomal protein L35  66.13 
 
 		 65 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000837102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1969  50S ribosomal protein L35  66.13 
 
 		 64 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00375988  hitchhiker  0.00635162 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28670  50S ribosomal protein L35  68.97 
 
 		 64 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000017021 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2506  50S ribosomal protein L35  68.97 
 
 		 64 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684912  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20440  50S ribosomal protein L35  64.52 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.836721  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0940  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 64 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000354984  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1998  50S ribosomal protein L35  64.52 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0506186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1978  50S ribosomal protein L35  64.52 
 
 		 64 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378736  normal  0.0703875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  56.25 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1758  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2122  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 64 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000215801  normal  0.0294636 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1801  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00132404  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2051  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0770661  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2489  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000637036  hitchhiker  0.0000746157 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1707  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0213276  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2026  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0783263  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2261  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 64 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000246297  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1890  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2182  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0779373  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2059  ribosomal protein L35  60.66 
 
 		 63 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.617937  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2328  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000825235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2186  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000722256  normal  0.0355999 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0429  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2016  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000210298  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2150  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000191739  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2220  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2030  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000722543  hitchhiker  0.0000219314 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  62  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000162638  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2301  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2019  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101706  normal  0.0487659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2045  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000199534  hitchhiker  0.00708309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>