202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0767 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0767  ribosomal protein L35  100 
 
 
66 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0751  50S ribosomal protein L35  59.09 
 
 
67 aa  87.4  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000137261  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_657  ribosomal protein L35  59.09 
 
 
67 aa  87  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000644452  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0679  50S ribosomal protein L35  59.09 
 
 
67 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000758197  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1033  ribosomal protein L35  54.69 
 
 
70 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.753254  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1435  ribosomal protein L35  52.46 
 
 
67 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240227  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  49.23 
 
 
66 aa  60.8  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  46.77 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  48.44 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  42.19 
 
 
65 aa  57  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  44.62 
 
 
65 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2417  ribosomal protein L35  43.55 
 
 
64 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  48.44 
 
 
65 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  43.55 
 
 
65 aa  55.5  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  48.21 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  46.97 
 
 
68 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  45.16 
 
 
64 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  44.62 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3521  50S ribosomal protein L35P  43.08 
 
 
65 aa  53.5  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0090517  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3162  hypothetical protein  42.19 
 
 
68 aa  53.9  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0249059  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  48.15 
 
 
64 aa  53.5  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1313  50S ribosomal protein L35  46.97 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.711955  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  44.62 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
64 aa  53.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  48.15 
 
 
64 aa  53.5  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1477  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.570064  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  43.55 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  39.06 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 
65 aa  51.6  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 
65 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  45.16 
 
 
64 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 
65 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  43.55 
 
 
64 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
66 aa  50.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  50.8  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  44.44 
 
 
64 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1384  50S ribosomal protein L35  42.42 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.0000000000768354  normal  0.0909264 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  45.16 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4143  ribosomal protein L35  43.55 
 
 
64 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000359181  hitchhiker  0.000240129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  45.16 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  43.55 
 
 
64 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  41.94 
 
 
63 aa  49.7  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  42.86 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  43.75 
 
 
65 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  37.5 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2607  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  47.06 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3499  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145508  normal  0.184731 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 
65 aa  48.1  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
65 aa  48.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  39.06 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0214  ribosomal protein L35  41.54 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0660989  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  40.32 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 
65 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 
65 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  37.5 
 
 
65 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1312  ribosomal protein L35  39.06 
 
 
65 aa  47.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000103845  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0535  ribosomal protein L35  41.54 
 
 
66 aa  47.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000240133  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  46.3 
 
 
66 aa  47.8  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4254  50S ribosomal protein L35  46.97 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0801  50S ribosomal protein L35  42.42 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3181  50S ribosomal protein L35  35.48 
 
 
64 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340502  normal  0.163577 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0450  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 
66 aa  47  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2384  ribosomal protein L35  40.32 
 
 
64 aa  47  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176561  normal  0.265482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>