256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5472 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5472  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 64 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25680  50S ribosomal protein L35  77.78 
 
 		 64 aa  97.8  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  73.44 
 
 		 64 aa  95.9  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2417  ribosomal protein L35  71.43 
 
 		 64 aa  92.8  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4143  ribosomal protein L35  67.19 
 
 		 64 aa  90.1  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000359181  hitchhiker  0.000240129 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21900  LSU ribosomal protein L35P  73.02 
 
 		 64 aa  87.8  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404594  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  65.08 
 
 		 64 aa  86.7  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  63.49 
 
 		 64 aa  83.2  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3053  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 64 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  63.49 
 
 		 64 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  66.67 
 
 		 64 aa  82  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  66.67 
 
 		 64 aa  80.9  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  65.08 
 
 		 64 aa  81.3  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1883  50S ribosomal protein L35  66.67 
 
 		 64 aa  80.5  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0659918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3327  50S ribosomal protein L35  66.13 
 
 		 64 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797164  normal  0.341501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2980  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 64 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415069  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3024  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 64 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.584231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2995  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 64 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138749  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1876  50S ribosomal protein L35  65.08 
 
 		 64 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.322523 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 64 aa  77  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3181  50S ribosomal protein L35  58.73 
 
 		 64 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340502  normal  0.163577 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  61.9 
 
 		 64 aa  77  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 64 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 64 aa  73.9  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 64 aa  73.9  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  58.73 
 
 		 63 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11659  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 64 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 64 aa  71.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12260  LSU ribosomal protein L35P  55.56 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162562  normal  0.135462 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 71 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 64 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 64 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  50 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1302  50S ribosomal protein L35P  48.44 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357951  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  46.77 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  46.88 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5321  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1609  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.0147184 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  48.44 
 
 		 65 aa  52  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1162  ribosomal protein L35  50 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000825182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  61.36 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2384  ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  51.6  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176561  normal  0.265482 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  46.77 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0170  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00827937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1343  ribosomal protein L35  49.18 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000164157  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1556  ribosomal protein L35  47.46 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.637628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6086  50S ribosomal protein L35P  48.15 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1713  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  50.4  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.971881  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1835  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  50.4  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0519771 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  46.77 
 
 		 66 aa  50.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0751  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000137261  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0040  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0165  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0076  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0679  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000758197  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2122  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000215801  normal  0.0294636 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0121  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.379431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0043  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0449  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 66 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0166  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.426785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0154  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_657  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000644452  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0429  ribosomal protein L35  39.68 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>