More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_20440 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_20440  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
64 aa  126  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.836721  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2467  50S ribosomal protein L35  90.62 
 
 
64 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110477  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3223  50S ribosomal protein L35  90.62 
 
 
64 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3479  50S ribosomal protein L35  90.62 
 
 
64 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0370445  normal  0.0138501 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1969  50S ribosomal protein L35  87.5 
 
 
64 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00375988  hitchhiker  0.00635162 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2380  ribosomal protein L35  85.94 
 
 
64 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2164  50S ribosomal protein L35  85.94 
 
 
64 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000105441  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1933  50S ribosomal protein L35  85.94 
 
 
64 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000771602  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1978  50S ribosomal protein L35  87.5 
 
 
64 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378736  normal  0.0703875 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2506  50S ribosomal protein L35  82.81 
 
 
64 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28670  50S ribosomal protein L35  82.81 
 
 
64 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000017021 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1579  50S ribosomal protein L35  76.19 
 
 
64 aa  94.7  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2059  ribosomal protein L35  73.33 
 
 
63 aa  86.3  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.617937  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1801  50S ribosomal protein L35  63.93 
 
 
64 aa  79.3  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00132404  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2318  50S ribosomal protein L35  69.49 
 
 
65 aa  77.4  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144382  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2301  50S ribosomal protein L35  69.49 
 
 
65 aa  77  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000837102  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1998  50S ribosomal protein L35  66.1 
 
 
65 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0506186  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02081  50S ribosomal protein L35  65.57 
 
 
64 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003714  LSU ribosomal protein L35p  63.93 
 
 
64 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000181829  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1758  50S ribosomal protein L35  65.57 
 
 
64 aa  72.4  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0940  50S ribosomal protein L35  60.66 
 
 
64 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000354984  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  57.81 
 
 
66 aa  70.9  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  57.81 
 
 
64 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  61.29 
 
 
65 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  64.52 
 
 
65 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 
65 aa  67.4  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  62.9 
 
 
65 aa  67.4  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  62.9 
 
 
65 aa  67.4  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 
65 aa  67.4  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  62.9 
 
 
65 aa  67.4  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  59.68 
 
 
65 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  58.06 
 
 
73 aa  66.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 
65 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2030  50S ribosomal protein L35  59.02 
 
 
64 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000722543  hitchhiker  0.0000219314 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2595  50S ribosomal protein L35  59.02 
 
 
64 aa  66.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000519025  hitchhiker  0.00116473 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2489  50S ribosomal protein L35  59.02 
 
 
64 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000637036  hitchhiker  0.0000746157 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 
64 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1707  50S ribosomal protein L35  59.02 
 
 
64 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0213276  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  56.92 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2026  50S ribosomal protein L35  59.02 
 
 
64 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0783263  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  56.25 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 
65 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2220  50S ribosomal protein L35  57.38 
 
 
64 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2186  50S ribosomal protein L35  57.38 
 
 
64 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000722256  normal  0.0355999 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2907  ribosomal protein L35  56.45 
 
 
101 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.471347  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2016  50S ribosomal protein L35  57.38 
 
 
64 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000210298  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2150  50S ribosomal protein L35  57.38 
 
 
64 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000191739  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2328  50S ribosomal protein L35  57.38 
 
 
64 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000825235  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  58.06 
 
 
65 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 
65 aa  64.3  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 
65 aa  64.3  0.0000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2852  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 
67 aa  63.9  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0103934 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  60.32 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2261  50S ribosomal protein L35  57.38 
 
 
64 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000246297  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  58.06 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  63.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2301  50S ribosomal protein L35  57.38 
 
 
64 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1957  50S ribosomal protein L35  57.38 
 
 
64 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  normal  0.347549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2019  50S ribosomal protein L35  57.38 
 
 
64 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101706  normal  0.0487659 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1767  50S ribosomal protein L35  57.38 
 
 
64 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852967  normal  0.0187188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2045  50S ribosomal protein L35  57.38 
 
 
64 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000199534  hitchhiker  0.00708309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2122  50S ribosomal protein L35  57.38 
 
 
64 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000215801  normal  0.0294636 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  56.45 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3091  ribosomal protein L35  56.45 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.848097  normal  0.0845178 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 
65 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
65 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0493  ribosomal protein L35  54.1 
 
 
63 aa  62  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
65 aa  61.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1450  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
67 aa  60.8  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
65 aa  61.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  56.45 
 
 
65 aa  61.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2104  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
67 aa  60.8  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365417  normal  0.232505 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
65 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2398  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
67 aa  60.8  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35653  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  54.69 
 
 
64 aa  60.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  51.61 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1872  ribosomal protein L35  56.45 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4614  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.0110084 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0994  50S ribosomal protein L35  60 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1579  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 
65 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 
65 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
65 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>