125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0476 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0476  ribosomal protein L35  100 
 
 		 64 aa  125  1.0000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0233  50S ribosomal protein L35  76.56 
 
 		 64 aa  92.8  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.378648  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  56.25 
 
 		 64 aa  66.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  64.3  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21900  LSU ribosomal protein L35P  50 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404594  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  45.16 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4143  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000359181  hitchhiker  0.000240129 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3181  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340502  normal  0.163577 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3053  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3327  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797164  normal  0.341501 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11659  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1883  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0659918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 66 aa  50.4  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1876  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.322523 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  54.35 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2384  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176561  normal  0.265482 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  50.91 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2417  ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25680  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  42.86 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  51.11 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12260  LSU ribosomal protein L35P  41.94 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162562  normal  0.135462 
 
 
-
 
NC_004310  BR2119  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517001  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2980  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415069  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2503  50S ribosomal protein L35  34.92 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3024  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.584231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2995  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138749  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2034  hypothetical protein  45.16 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0801  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  39.68 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5472  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0214  ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0660989  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  35.48 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  38.71 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  37.1 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1313  50S ribosomal protein L35  53.49 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.711955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  40.62 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  46 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0751  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000137261  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  39.29 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0573  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0216  50S ribosomal protein L35  44 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  34.92 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1162  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000825182  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  34.92 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5321  50S ribosomal protein L35  33.33 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_657  ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000644452  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6086  50S ribosomal protein L35P  48.15 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  34.92 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  33.33 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  37.1 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  42 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  33.87 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3042  50S ribosomal protein L35  36.21 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0165  50S ribosomal protein L35  34.92 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  40 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1835  50S ribosomal protein L35  40 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0519771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1477  50S ribosomal protein L35  51.11 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.570064  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  38.1 
 
 		 65 aa  42  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 65 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1765  50S ribosomal protein L35  40.68 
 
 		 66 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  42 
 
 		 65 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1713  50S ribosomal protein L35  33.87 
 
 		 64 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.971881  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0449  50S ribosomal protein L35  33.33 
 
 		 66 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  35.48 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0411  50S ribosomal protein L35  40.68 
 
 		 66 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2487  50S ribosomal protein L35  40.68 
 
 		 66 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  37.1 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0205  50S ribosomal protein L35  41.38 
 
 		 67 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2274  50S ribosomal protein L35  40.68 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.5439  normal  0.30406 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>