30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0573 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0573  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 67 aa  130  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1252  ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.695643  normal  0.22222 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1384  50S ribosomal protein L35  53.45 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.0000000000768354  normal  0.0909264 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0205  50S ribosomal protein L35  48.15 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3484  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2432  50S ribosomal protein L35  45 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2514  50S ribosomal protein L35  74.19 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4533  50S ribosomal protein L35  42.42 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4268  50S ribosomal protein L35  42.42 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0476  ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 64 aa  43.5  0.0009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0450  50S ribosomal protein L35  67.74 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1315  50S ribosomal protein L35  39.39 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1933  ribosomal protein L35  36.36 
 
 		 403 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317128  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3042  50S ribosomal protein L35  39.39 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0214  ribosomal protein L35  44.83 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0660989  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2922  50S ribosomal protein L35  67.74 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0204  50S ribosomal protein L35  39.68 
 
 		 63 aa  42  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2119  50S ribosomal protein L35  46.3 
 
 		 66 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517001  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0135  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0198  50S ribosomal protein L35  43.1 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0218  ribosomal protein L35  39.66 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0801  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2034  hypothetical protein  46.3 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0040  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0043  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0166  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.426785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3091  50S ribosomal protein L35  64.52 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.0357819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 67 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 67 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0216  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 66 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>