119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1252 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1252  ribosomal protein L35  100 
 
 		 65 aa  131  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.695643  normal  0.22222 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1384  50S ribosomal protein L35  73.85 
 
 		 66 aa  101  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.0000000000768354  normal  0.0909264 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0573  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 67 aa  63.5  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21900  LSU ribosomal protein L35P  45.16 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404594  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  44.62 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2514  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 66 aa  50.4  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  35.94 
 
 		 65 aa  50.8  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  37.5 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3053  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  43.55 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0128  50S ribosomal protein L35P  49.21 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0134182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  46.15 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1609  50S ribosomal protein L35  42.42 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.0147184 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  37.5 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  40.62 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  34.38 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3181  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340502  normal  0.163577 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0450  50S ribosomal protein L35  40 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  40.91 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3042  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  40.91 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2119  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517001  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1765  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0491  ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0411  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2487  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0218  ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0230  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5321  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0767  ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1835  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0519771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0205  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  35.94 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2274  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.5439  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2034  hypothetical protein  42.86 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0801  50S ribosomal protein L35  41.27 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5472  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0673  50S ribosomal protein L35P  40 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  37.5 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2155  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000190573  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119658  ribosomal protein L35, chloroplast precursor  67.65 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2417  ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3327  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797164  normal  0.341501 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0535  ribosomal protein L35  40 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000240133  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0214  ribosomal protein L35  37.88 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0660989  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  40.62 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  41.27 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1162  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000825182  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2432  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1033  ribosomal protein L35  40 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.753254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1933  ribosomal protein L35  52.27 
 
 		 403 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317128  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2607  50S ribosomal protein L35  44.78 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0189  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3499  50S ribosomal protein L35  44.78 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145508  normal  0.184731 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  37.1 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1753  50S ribosomal protein L35  37.5 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0043  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0449  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0166  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.426785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2940  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18511  50S ribosomal protein L35  37.5 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.752965  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1192  50S ribosomal protein L35  37.5 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0040  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0198  50S ribosomal protein L35  35.38 
 
 		 66 aa  42  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18701  50S ribosomal protein L35  35.94 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.951627  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18511  50S ribosomal protein L35  35.94 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.428259  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1883  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0659918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11659  50S ribosomal protein L35  35.48 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4254  50S ribosomal protein L35  36.36 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3162  hypothetical protein  43.55 
 
 		 68 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0249059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1477  50S ribosomal protein L35  34.38 
 
 		 65 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.570064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4533  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 67 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 64 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0135  50S ribosomal protein L35  35.38 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2980  50S ribosomal protein L35  35.48 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>