112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1033 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1033  ribosomal protein L35  100 
 
 		 70 aa  138  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.753254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1435  ribosomal protein L35  94.03 
 
 		 67 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0767  ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0679  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000758197  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0751  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000137261  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_657  ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000644452  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3181  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340502  normal  0.163577 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  40 
 
 		 65 aa  50.1  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  40 
 
 		 65 aa  50.1  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  40 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  35.38 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2417  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  48.9  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  39.06 
 
 		 79 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  68.75 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25680  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6086  50S ribosomal protein L35P  65.62 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  42.19 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  35.38 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  42.42 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  40 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  37.5 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  36.92 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  38.46 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3162  hypothetical protein  45.16 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0249059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3327  50S ribosomal protein L35  47.37 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797164  normal  0.341501 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  38.46 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  37.5 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  45.61 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1252  ribosomal protein L35  40 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.695643  normal  0.22222 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1477  50S ribosomal protein L35  40 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.570064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  37.5 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0214  ribosomal protein L35  40 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0660989  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1202  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750634  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11659  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  40 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5472  50S ribosomal protein L35  41.27 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  37.5 
 
 		 65 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2980  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 64 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415069  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3024  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 64 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.584231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2995  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 64 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138749  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  37.5 
 
 		 65 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  40 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  40 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  38.71 
 
 		 65 aa  42  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  59.38 
 
 		 64 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  40.32 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4143  ribosomal protein L35  35.48 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000359181  hitchhiker  0.000240129 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  34.38 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  38.46 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3053  50S ribosomal protein L35  37.1 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1254  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00450085  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12260  LSU ribosomal protein L35P  38.71 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162562  normal  0.135462 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  36.92 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  38.46 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  38.46 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  38.46 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  38.46 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  38.46 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 65 aa  41.2  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  35.38 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  38.46 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  38.46 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  38.46 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  38.46 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  38.46 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1384  50S ribosomal protein L35  40 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.0000000000768354  normal  0.0909264 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3499  50S ribosomal protein L35  40.3 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145508  normal  0.184731 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>