12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3162 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3162  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  138  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0249059  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0767  ribosomal protein L35  42.19 
 
 
66 aa  53.9  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0751  50S ribosomal protein L35  33.85 
 
 
67 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000137261  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_657  ribosomal protein L35  33.85 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000644452  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1033  ribosomal protein L35  45.16 
 
 
70 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.753254  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0679  50S ribosomal protein L35  33.85 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000758197  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  46.15 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1252  ribosomal protein L35  43.55 
 
 
65 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.695643  normal  0.22222 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  45.45 
 
 
64 aa  41.2  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1384  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.0000000000768354  normal  0.0909264 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1435  ribosomal protein L35  42.62 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240227  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  38.33 
 
 
64 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>