71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1384 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1384  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 66 aa  133  9e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.0000000000768354  normal  0.0909264 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1252  ribosomal protein L35  73.85 
 
 		 65 aa  101  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.695643  normal  0.22222 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0573  50S ribosomal protein L35  53.45 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0767  ribosomal protein L35  42.42 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  40.91 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  40.32 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1162  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000825182  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1686  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  40 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21900  LSU ribosomal protein L35P  38.71 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404594  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  39.68 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  43.75 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  35.48 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  40 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3053  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1313  50S ribosomal protein L35  41.79 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.711955  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  37.1 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  35.48 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  37.5 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0491  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  37.5 
 
 		 65 aa  43.5  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0751  50S ribosomal protein L35  39.39 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000137261  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0233  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.378648  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2354  ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0495089  normal  0.100327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0450  50S ribosomal protein L35  40 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  35.94 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  38.1 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  40.62 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  35.48 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_657  ribosomal protein L35  39.39 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000644452  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2514  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  35.94 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0411  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  35.48 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0214  ribosomal protein L35  40.91 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0660989  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3181  50S ribosomal protein L35  35.48 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340502  normal  0.163577 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1765  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  37.5 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  33.85 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3521  50S ribosomal protein L35P  37.5 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0090517  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2487  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1302  50S ribosomal protein L35P  37.1 
 
 		 65 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357951  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  37.1 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3162  hypothetical protein  40.62 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0249059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0189  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3042  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  37.1 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0128  50S ribosomal protein L35P  41.27 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0134182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  42.19 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2274  50S ribosomal protein L35  40 
 
 		 66 aa  40.8  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.5439  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  37.5 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11659  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0661  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0982  50S ribosomal protein L35  35.94 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0841883 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1033  ribosomal protein L35  40 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.753254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2417  ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0679  50S ribosomal protein L35  37.88 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000758197  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3327  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797164  normal  0.341501 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119658  ribosomal protein L35, chloroplast precursor  57.14 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf193  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 62 aa  40  0.01  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000550484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>