154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2502 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2502  ribosomal protein L35  100 
 
 		 66 aa  133  8e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1343  ribosomal protein L35  53.57 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000164157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  48.28 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1753  50S ribosomal protein L35  51.72 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  50 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  47.46 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2768  50S ribosomal protein L35  46.67 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2641  50S ribosomal protein L35  46.67 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  43.75 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  51.72 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18701  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.951627  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18511  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.428259  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18511  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.752965  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  50 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  53.45 
 
 		 64 aa  51.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  45.31 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  46.55 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0470  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.835953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 66 aa  50.8  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  48.28 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  48.28 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  48.28 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  43.1 
 
 		 79 aa  50.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  46.55 
 
 		 64 aa  50.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  43.55 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  46.55 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  46.55 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  46.55 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  44.83 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  46.55 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  48.28 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  43.1 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  44.83 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  46.55 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  44.83 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  41.38 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  43.1 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0347  ribosomal protein L35  46.43 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05600  ribosomal protein L35  54 
 
 		 57 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612539  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  46.55 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  44.83 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  48.28 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  48.28 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  46.55 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  46.55 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0223  50S ribosomal protein L35  40 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.0000237579  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  41.38 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  39.66 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  46 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  44.83 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  43.1 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2595  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000519025  hitchhiker  0.00116473 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1579  50S ribosomal protein L35  41.27 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  43.1 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  46.55 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1408  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.62666e-18  unclonable  7.5203e-29 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  54.55 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  43.1 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2150  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000191739  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2186  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000722256  normal  0.0355999 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  43.1 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2220  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2328  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000825235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  44.83 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  54.55 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  39.68 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3181  50S ribosomal protein L35  49.12 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340502  normal  0.163577 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1707  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0213276  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3327  50S ribosomal protein L35  44.83 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797164  normal  0.341501 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>