227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0222 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0222  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 64 aa  126  8.000000000000001e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.0000299958  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  52.94 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1556  ribosomal protein L35  52.73 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.637628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  40.32 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  49.02 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2354  ribosomal protein L35  48.28 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0495089  normal  0.100327 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  51.92 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  41.94 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  38.71 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  44.23 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0165  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 64 aa  50.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  38.71 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  42.31 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  37.5 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  46.3 
 
 		 66 aa  48.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0170  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00827937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  36.51 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1726  50S ribosomal protein L35  40.35 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0353101  normal  0.481897 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5321  50S ribosomal protein L35  36.51 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  40.35 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  42.31 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0154  50S ribosomal protein L35  39.68 
 
 		 64 aa  47.8  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0488  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000885309  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0982  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0841883 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02081  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  36.51 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  36.51 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1302  50S ribosomal protein L35P  37.5 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357951  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  36.51 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5472  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  42 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1383  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 66 aa  47  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000504728  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  41.38 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1890  50S ribosomal protein L35  40.35 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2186  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000722256  normal  0.0355999 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1753  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  43.75 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2328  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000825235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1609  50S ribosomal protein L35  36.51 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.0147184 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2032  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 66 aa  47  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000178716  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  41.38 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2503  50S ribosomal protein L35  35.94 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2220  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2182  50S ribosomal protein L35  40.35 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0779373  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003714  LSU ribosomal protein L35p  41.94 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000181829  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  40.32 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101932 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  44.26 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2150  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000191739  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18511  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.752965  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  43.64 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  38.46 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  47.83 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1758  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1707  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0213276  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1798  50S ribosomal protein L35  38.6 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000060614  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  47.83 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1838  50S ribosomal protein L35  38.6 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121921  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2010  50S ribosomal protein L35  38.6 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.800044 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2026  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0783263  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1430  50S ribosomal protein L35  38.6 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000901433  normal  0.0165189 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1915  50S ribosomal protein L35  38.6 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414534  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2489  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000637036  hitchhiker  0.0000746157 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0174  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1474  50S ribosomal protein L35  38.6 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0002542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01675  hypothetical protein  38.6 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0162765  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>