247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1383 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1383  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
66 aa  127  6e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000504728  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1088  50S ribosomal protein L35  86.36 
 
 
66 aa  115  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000177578  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2032  50S ribosomal protein L35  80.3 
 
 
66 aa  107  8.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000178716  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1408  50S ribosomal protein L35  77.27 
 
 
66 aa  103  7e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.62666e-18  unclonable  7.5203e-29 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  72.73 
 
 
66 aa  92  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  66.67 
 
 
66 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  66.67 
 
 
66 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  66.67 
 
 
66 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  66.67 
 
 
66 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  66.67 
 
 
66 aa  84.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  66.67 
 
 
66 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  66.67 
 
 
66 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  66.67 
 
 
66 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  66.67 
 
 
66 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  65.15 
 
 
66 aa  84.3  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  66.67 
 
 
66 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  66.67 
 
 
66 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  66.13 
 
 
66 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1279  50S ribosomal protein L35P  63.08 
 
 
65 aa  79  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.686056  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1442  50S ribosomal protein L35  64.62 
 
 
65 aa  79  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000414498  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  64.52 
 
 
66 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  64.52 
 
 
66 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1240  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 
65 aa  74.7  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000491229  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
65 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  51.61 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  51.61 
 
 
65 aa  62  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
65 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
65 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  61.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  60.8  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  60.5  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl189  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
64 aa  60.5  0.000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172022  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0204  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
63 aa  59.7  0.00000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  53.97 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 
65 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  52.38 
 
 
64 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
64 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
65 aa  57.4  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0165  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
64 aa  57  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.442287  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  46.77 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
65 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1726  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
65 aa  55.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0353101  normal  0.481897 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  51.85 
 
 
66 aa  55.1  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2146  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
65 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145013  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  43.55 
 
 
64 aa  54.3  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  46.77 
 
 
94 aa  54.3  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  46.15 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2051  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0770661  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  44.62 
 
 
65 aa  53.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  44.62 
 
 
65 aa  53.9  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
65 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  53.5  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  46.15 
 
 
65 aa  53.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01686  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0100016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1925  ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359648  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1474  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0002542  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2182  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0779373  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1838  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121921  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1959  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000143205  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  45.16 
 
 
79 aa  52.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2010  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.800044 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05600  ribosomal protein L35  50.88 
 
 
57 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612539  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1798  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000060614  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2435  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000580293  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1915  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414534  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  46.88 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01675  hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0162765  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1446  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109072  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1463  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.3269  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1890  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1343  ribosomal protein L35  48.33 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000164157  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1430  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000901433  normal  0.0165189 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0170  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00827937  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  50 
 
 
63 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  45.16 
 
 
65 aa  51.6  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
64 aa  51.6  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  51.6  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000162638  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
81 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>