51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2354 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2354  ribosomal protein L35  100 
 
 		 64 aa  124  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0495089  normal  0.100327 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1556  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.637628  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0222  50S ribosomal protein L35  48.28 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.0000299958  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1753  50S ribosomal protein L35  49.18 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18511  50S ribosomal protein L35  49.18 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.752965  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18511  50S ribosomal protein L35  47.54 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.428259  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18701  50S ribosomal protein L35  47.54 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.951627  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  48.28 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  36.67 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  43.33 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  40.98 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  39.34 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0535  ribosomal protein L35  42.62 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000240133  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  36.07 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0685  50S ribosomal protein L35  37.1 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513198  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  44.26 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1384  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.0000000000768354  normal  0.0909264 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  41.38 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  40 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  40 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1313  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.711955  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  40.68 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  44.83 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  37.1 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  38.98 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  38.98 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  40.98 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  44.83 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0982  50S ribosomal protein L35  34.43 
 
 		 65 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0841883 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  42.62 
 
 		 65 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2432  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 67 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  40.68 
 
 		 64 aa  41.2  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  36.07 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2489  50S ribosomal protein L35  42.62 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000637036  hitchhiker  0.0000746157 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1707  50S ribosomal protein L35  42.62 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0213276  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2026  50S ribosomal protein L35  42.62 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0783263  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0488  50S ribosomal protein L35  37.7 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000885309  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  42.62 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2940  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  39.34 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  42.62 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  42.62 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3091  50S ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.0357819 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  36.67 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  36.07 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3499  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 67 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145508  normal  0.184731 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2150  50S ribosomal protein L35  40.98 
 
 		 64 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000191739  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2220  50S ribosomal protein L35  40.98 
 
 		 64 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2607  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 67 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2186  50S ribosomal protein L35  40.98 
 
 		 64 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000722256  normal  0.0355999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2328  50S ribosomal protein L35  40.98 
 
 		 64 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000825235  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>