133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5675 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5675  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 151 aa  300  5.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.065322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6244  transposase IS3/IS911 family protein  72.19 
 
 		 151 aa  207  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4730  putative SyrB-like regulator  47.68 
 
 		 144 aa  115  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0141  SyrB family protein, putative  52.04 
 
 		 145 aa  91.7  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4606  SyrB2 regulator  44.94 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.378272 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5440  hypothetical protein  36.6 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.983092  hitchhiker  0.0031733 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6142  hypothetical protein  70.45 
 
 		 224 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.551083  normal  0.349913 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4899  hypothetical protein  81.08 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.338147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5545  hypothetical protein  74.36 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000151722 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6024  hypothetical protein  74.36 
 
 		 220 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7865  transposase IS3/IS911 family protein  35 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2942  transposase subfamily protein  36.56 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342551  hitchhiker  1.76227e-24 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  42.67 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1054  transposase IS3/IS911 family protein  37.33 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298359  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1083  transposase IS3/IS911 family protein  37.33 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5379  transposase IS3/IS911 family protein  37.33 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.543472  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0345  transposase IS3/IS911 family protein  37.33 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3816  transposase IS3/IS911 family protein  37.33 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3840  transposase IS3/IS911 family protein  37.33 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1137  transposase IS3/IS911 family protein  37.63 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.000000141669 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0797  transposase IS3/IS911 family protein  36 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1826  transposase IS3/IS911 family protein  36 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3556  hypothetical protein  36 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  41.33 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4807  transposase subfamily  35.48 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.650973  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3069  transposase family protein  35.48 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4892  transposase family protein  34.41 
 
 		 92 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0142849 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2300  transposase IS3/IS911 family protein  34.94 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.356728  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3081  transposase IS3/IS911 family protein  34.94 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0442  transposase IS3/IS911 family protein  37.84 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.855822 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  40.54 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  40.54 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17080  Transposase  33.98 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08100  Transposase  33.98 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.721014 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2882  transposase IS3/IS911 family protein  34.88 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935915  normal  0.211621 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22010  Transposase  33.98 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.124801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6820  transposase IS3/IS911 family protein  37.97 
 
 		 79 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4220  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0720  transposase subfamily  38.55 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.116485 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1332  transposase IS3/IS911-family  30.23 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_777  transposase IS3/IS911-family  30.23 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_64  transposase IS3/IS911-family  30.23 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_89  transposase IS3/IS911-family  30.23 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3414  transposase IS3/IS911 family protein  32.94 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0093  transposase  36.14 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.426296 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0132  isrso12-transposase orfa protein  36.14 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183288  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3926  transposase IS3/IS911 family protein  36.14 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287084  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1309  transposase IS3/IS911-family  30.23 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0066  transposase IS3/IS911 family protein  36.59 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4321  transposase IS3/IS911 family protein  32.53 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.583527  normal  0.389304 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4474  transposase IS3/IS911 family protein  34.09 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1972  hypothetical protein  35.23 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.806101 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4237  transposase IS3/IS911 family protein  34.48 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219099  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1291  transposase IS3/IS911 family protein  29.76 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1111  transposase IS3/IS911 family protein  36.14 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5527  transposase IS3/IS911 family protein  36.14 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.100543 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0199  hypothetical protein  35.63 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1078  hypothetical protein  35.63 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3339  transposase IS3/IS911 family protein  37.84 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2906  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000119814  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3127  transposase IS3/IS911  31.33 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.800536  normal  0.701441 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3534  transposase IS3/IS911  31.33 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.545436  normal  0.522486 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2969  transposase IS3/IS911  31.33 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2016  transposase IS3/IS911 family protein  30.38 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1508  ISDet3, transposase orfA  32.56 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.140272  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3246  transposase IS3/IS911  31.33 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00639582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0116  transposase IS3/IS911 family protein  32.56 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0272  transposase IS3/IS911 family protein  32.56 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0288  transposase IS3/IS911 family protein  32.56 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1300  transposase IS3/IS911 family protein  32.56 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0143  IS3/IS911 family transposase  36.49 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0204  IS3/IS911 family transposase  36.49 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0209  IS3/IS911 family transposase  36.49 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.599747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1235  putative transposase  36.49 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0720605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2011  transposase IS3/IS911  35.63 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0440  putative transposase  36.49 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.468029 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3583  transposase IS3/IS911 family protein  30.38 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0857  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1624  transposase IS3/IS911 family protein  32.53 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02903  transposase ORF-A, IS-type  32.98 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1443  transposase IS3/IS911  34.48 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1571  transposase IS3/IS911  34.48 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1694  transposase IS3/IS911  34.48 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.233674  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2056  transposase IS3/IS911  34.48 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0286844  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5068  transposase IS3/IS911 family protein  33.8 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0379  transposase IS3/IS911 family protein  30.12 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.563054  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  37.08 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  37.08 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  37.08 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0275  transposase IS3/IS911 family protein  34.15 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0431  transposase IS3/IS911 family protein  34.15 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2228  transposase IS3/IS911 family protein  34.15 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2355  transposase IS3/IS911 family protein  34.15 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  35.05 
 
 		 96 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  35.05 
 
 		 96 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4909  transposase IS3/IS911 family protein  32 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  35.05 
 
 		 96 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  35.05 
 
 		 96 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3515  hypothetical protein  36.84 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0245  transposase IS3 family protein  40.91 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>