14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6142 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6142  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.551083  normal  0.349913 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4899  hypothetical protein  60.99 
 
 
220 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.338147  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6024  hypothetical protein  57.4 
 
 
220 aa  205  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5440  hypothetical protein  84.44 
 
 
135 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.983092  hitchhiker  0.0031733 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5545  hypothetical protein  53.12 
 
 
189 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000151722 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5675  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
151 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.065322  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6244  transposase IS3/IS911 family protein  60.42 
 
 
151 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286208  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5676  hypothetical protein  27.59 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167511  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4730  putative SyrB-like regulator  65.22 
 
 
144 aa  58.9  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4604  hypothetical protein  28.57 
 
 
193 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74916  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6374  hypothetical protein  29.77 
 
 
186 aa  51.6  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4731  hypothetical protein  40.91 
 
 
189 aa  48.9  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0141  SyrB family protein, putative  54.76 
 
 
145 aa  48.9  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4606  SyrB2 regulator  43.75 
 
 
143 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.378272 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>