92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0141 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0141  SyrB family protein, putative  100 
 
 		 145 aa  300  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5675  transposase IS3/IS911 family protein  52.04 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.065322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6244  transposase IS3/IS911 family protein  47.52 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4730  putative SyrB-like regulator  38.64 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2942  transposase subfamily protein  42.86 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342551  hitchhiker  1.76227e-24 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4807  transposase subfamily  40.91 
 
 		 88 aa  57  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.650973  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3069  transposase family protein  40.91 
 
 		 88 aa  57  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4892  transposase family protein  38.96 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0142849 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5440  hypothetical protein  53.33 
 
 		 135 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.983092  hitchhiker  0.0031733 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3081  transposase IS3/IS911 family protein  40.3 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2300  transposase IS3/IS911 family protein  38.96 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.356728  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3926  transposase IS3/IS911 family protein  37.8 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287084  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6142  hypothetical protein  54.76 
 
 		 224 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.551083  normal  0.349913 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7865  transposase IS3/IS911 family protein  37.8 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0093  transposase  37.8 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.426296 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0132  isrso12-transposase orfa protein  37.8 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183288  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_002936  DET0083  ISDet1, transposase orfA  35.71 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.376944  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1972  hypothetical protein  38.75 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.806101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5379  transposase IS3/IS911 family protein  35.37 
 
 		 91 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.543472  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1083  transposase IS3/IS911 family protein  35.37 
 
 		 91 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1054  transposase IS3/IS911 family protein  35.37 
 
 		 91 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298359  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0345  transposase IS3/IS911 family protein  35.37 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3816  transposase IS3/IS911 family protein  35.37 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4321  transposase IS3/IS911 family protein  38.81 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.583527  normal  0.389304 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5527  transposase IS3/IS911 family protein  37.14 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.100543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1111  transposase IS3/IS911 family protein  37.14 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6820  transposase IS3/IS911 family protein  39.02 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0066  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0007  transposase IS3/IS911 family protein  34.69 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2559  transposase IS3/IS911  34.69 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4899  hypothetical protein  61.76 
 
 		 220 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.338147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5545  hypothetical protein  52.38 
 
 		 189 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000151722 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0557  ISRSO16-transposase OrfA protein  33.72 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.235174 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6024  hypothetical protein  52.38 
 
 		 220 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0379  transposase IS3/IS911 family protein  37.31 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.563054  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0156  transposase InsG for insertion sequence IS1353  38.67 
 
 		 514 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0720  transposase subfamily  36.59 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.116485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3840  transposase IS3/IS911 family protein  34.15 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6861  transposase IS3/IS911 family protein  34.12 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232506  normal  0.190073 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4520  IS3/IS911 family transposase A  32.94 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000777217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2633  IS3/IS911 family transposase A  32.94 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000594495  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0857  hypothetical protein  36.25 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1137  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.000000141669 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0797  transposase IS3/IS911 family protein  34.15 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1624  transposase IS3/IS911 family protein  37.31 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3837  transposase IS3/IS911 family protein  35.21 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2285  transposase IS3/IS911 family protein  35.21 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0445809  normal  0.0110111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2278  transposase IS3/IS911 family protein  35.21 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00023086  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0125  transposase IS3/IS911 family protein  35.21 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6172  transposase IS3/IS911 family protein  35.21 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4865  transposase IS3/IS911  32.94 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3300  transposase IS3/IS911 family protein  32.94 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3556  hypothetical protein  34.15 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1826  transposase IS3/IS911 family protein  34.15 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3621  transposase IS3/IS911  30.59 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.871396  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3127  transposase IS3/IS911  37.93 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.800536  normal  0.701441 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3534  transposase IS3/IS911  37.93 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.545436  normal  0.522486 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2969  transposase IS3/IS911  37.93 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1495  transposase IS3/IS911 family protein  31.4 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1548  transposase IS3/IS911 family protein  32.5 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3246  transposase IS3/IS911  37.93 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00639582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4606  SyrB2 regulator  79.17 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.378272 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2756  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2906  Fis family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000119814  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0199  hypothetical protein  35 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1078  hypothetical protein  35 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0442  transposase IS3/IS911 family protein  31.33 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2634  transposase IS3/IS911 family protein  31.33 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2927  transposase IS3/IS911 family protein  31.33 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4740  transposase IS3/IS911 family protein  31.33 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6104  transposase IS3/IS911 family protein  31.33 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2882  transposase IS3/IS911 family protein  32.1 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935915  normal  0.211621 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7752  putative insertion element ISR1-like protein  38.89 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619622  normal  0.112312 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4006  transposase IS3/IS911 family protein  30.53 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0959  transposase IS3/IS911 family protein  31.33 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1725  transposase A  30.86 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0961  transposase A  30.86 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.092394  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0785  transposase A  30.86 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1550  transposase A  30.86 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0157  transposase A  30.86 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.913666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3885  transposase A  30.86 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3882  transposase A  30.86 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3813  transposase A  30.86 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.633568  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2708  transposase A  30.86 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406372  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0091  transposase A  30.86 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.582456  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 370 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 370 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 370 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 370 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 370 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 370 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 370 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>