54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6244 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6244  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 151 aa  301  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5675  transposase IS3/IS911 family protein  72.19 
 
 		 151 aa  207  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.065322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4730  putative SyrB-like regulator  41.61 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0141  SyrB family protein, putative  47.52 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5440  hypothetical protein  68.18 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.983092  hitchhiker  0.0031733 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6142  hypothetical protein  60.42 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.551083  normal  0.349913 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4899  hypothetical protein  75.68 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.338147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5545  hypothetical protein  59.57 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000151722 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6024  hypothetical protein  59.57 
 
 		 220 aa  57.4  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7865  transposase IS3/IS911 family protein  38.67 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1054  transposase IS3/IS911 family protein  37.33 
 
 		 91 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.298359  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1083  transposase IS3/IS911 family protein  37.33 
 
 		 91 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5379  transposase IS3/IS911 family protein  37.33 
 
 		 91 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.543472  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0797  transposase IS3/IS911 family protein  34.67 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3840  transposase IS3/IS911 family protein  37.33 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3816  transposase IS3/IS911 family protein  37.33 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0345  transposase IS3/IS911 family protein  37.33 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3556  hypothetical protein  34.67 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1826  transposase IS3/IS911 family protein  34.67 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4606  SyrB2 regulator  35.15 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.378272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4337  transposase IS3/IS911 family protein  38.67 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2011  transposase IS3/IS911  42.37 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6820  transposase IS3/IS911 family protein  36.71 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2942  transposase subfamily protein  36.36 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342551  hitchhiker  1.76227e-24 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3530  transposase IS3/IS911 family protein  38.67 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1694  transposase IS3/IS911  40.68 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.233674  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1571  transposase IS3/IS911  40.68 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2056  transposase IS3/IS911  40.68 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0286844  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1443  transposase IS3/IS911  40.68 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3069  transposase family protein  35.06 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4807  transposase subfamily  35.06 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.650973  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0639  transposase IS3/IS911  30.4 
 
 		 124 aa  41.2  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1944  transposase IS3/IS911  30.4 
 
 		 124 aa  41.2  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1931  transposase IS3/IS911  30.4 
 
 		 124 aa  41.2  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1491  transposase IS3/IS911  30.4 
 
 		 124 aa  41.2  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0660911  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1017  transposase IS3/IS911  30.4 
 
 		 124 aa  41.2  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0871  transposase IS3/IS911  30.4 
 
 		 124 aa  41.2  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1965  transposase IS3/IS911  30.4 
 
 		 124 aa  41.2  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0866  transposase IS3/IS911  30.4 
 
 		 124 aa  41.2  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0783  transposase IS3/IS911  30.4 
 
 		 124 aa  41.2  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0659  transposase IS3/IS911  30.4 
 
 		 124 aa  41.2  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2867  transposase IS3/IS911  30.4 
 
 		 124 aa  41.2  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2046  transposase IS3/IS911  30.4 
 
 		 124 aa  41.2  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2081  transposase IS3/IS911  30.4 
 
 		 124 aa  41.2  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2100  transposase IS3/IS911  30.4 
 
 		 124 aa  41.2  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2136  transposase IS3/IS911  30.4 
 
 		 124 aa  41.2  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2357  transposase IS3/IS911  30.4 
 
 		 124 aa  41.2  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0428135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2666  transposase IS3/IS911  30.4 
 
 		 124 aa  41.2  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0465233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2673  transposase IS3/IS911  30.4 
 
 		 124 aa  41.2  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2820  transposase IS3/IS911  30.4 
 
 		 124 aa  41.2  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3087  putative transposase  30.4 
 
 		 124 aa  41.2  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4237  transposase IS3/IS911 family protein  34.48 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219099  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1495  transposase IS3/IS911 family protein  37.84 
 
 		 93 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.824912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4813  transposase IS3/IS911 family protein  37.84 
 
 		 93 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>