41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36800 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36800  hypothetical protein  100 
 
 		 482 aa  954    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0161837  normal  0.220338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0087  pyrrolo-quinoline quinone  64.95 
 
 		 454 aa  509  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0152  pyrrolo-quinoline quinone  64.19 
 
 		 429 aa  506  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0563094 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0090  Pyrrolo-quinoline quinone  66.12 
 
 		 444 aa  496  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3748  putative secreted protein  61.98 
 
 		 434 aa  470  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440402  hitchhiker  0.00438258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4108  putative secreted protein  59.11 
 
 		 455 aa  456  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1163  hypothetical protein  55.15 
 
 		 400 aa  425  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.340868  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1380  hypothetical protein  50.23 
 
 		 447 aa  422  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369053  normal  0.0607438 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2855  hypothetical protein  57.62 
 
 		 403 aa  420  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2871  hypothetical protein  48.92 
 
 		 410 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2434  hypothetical protein  49.11 
 
 		 414 aa  383  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6283  hypothetical protein  49.74 
 
 		 411 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3560  putative secreted protein  51.5 
 
 		 408 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5323  hypothetical protein  50.38 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30770  hypothetical protein  45.31 
 
 		 444 aa  363  4e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4808  hypothetical protein  49.34 
 
 		 389 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4722  hypothetical protein  49.34 
 
 		 389 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347098  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5107  hypothetical protein  49.34 
 
 		 389 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129857  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21130  hypothetical protein  43.58 
 
 		 493 aa  314  2.9999999999999996e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1070  hypothetical protein  44.6 
 
 		 404 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4007  hypothetical protein  28.3 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275688  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4097  hypothetical protein  26.42 
 
 		 412 aa  127  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2473  hypothetical protein  27.66 
 
 		 410 aa  126  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2378  hypothetical protein  29.86 
 
 		 394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.898929  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2445  hypothetical protein  25.21 
 
 		 405 aa  96.3  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1598  hypothetical protein  25.75 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1977  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  27.18 
 
 		 451 aa  88.6  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2837  hypothetical protein  24.8 
 
 		 383 aa  87  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2857  lipoprotein  28.03 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1165  putative ABC transporter  29.38 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.384071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6285  hypothetical protein  26 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0294  putative lipoprotein  26.17 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0347372  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5109  hypothetical protein  26.01 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11867  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1901  putative lipoprotein  21.08 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380336  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1421  hypothetical protein  21.5 
 
 		 439 aa  53.5  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4863  hypothetical protein  24.77 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3290  hypothetical protein  22.63 
 
 		 404 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1072  hypothetical protein  29.26 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5325  ABC-3 protein  50 
 
 		 664 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4810  putative ABC transporter  25.88 
 
 		 257 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.582677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4724  putative ABC transporter  25.88 
 
 		 254 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>