31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1070 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1070  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  808    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1163  hypothetical protein  46.27 
 
 
400 aa  333  4e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.340868  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5323  hypothetical protein  44.03 
 
 
397 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2855  hypothetical protein  42.86 
 
 
403 aa  298  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3748  putative secreted protein  42.82 
 
 
434 aa  296  3e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440402  hitchhiker  0.00438258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36800  hypothetical protein  44.6 
 
 
482 aa  293  4e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0161837  normal  0.220338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0087  pyrrolo-quinoline quinone  42.82 
 
 
454 aa  290  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0152  pyrrolo-quinoline quinone  43 
 
 
429 aa  291  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0563094 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5107  hypothetical protein  42.44 
 
 
389 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129857  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4808  hypothetical protein  42.44 
 
 
389 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4722  hypothetical protein  42.44 
 
 
389 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347098  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6283  hypothetical protein  43.13 
 
 
411 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4108  putative secreted protein  41.19 
 
 
455 aa  272  7e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2871  hypothetical protein  38.69 
 
 
410 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3560  putative secreted protein  40.45 
 
 
408 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2434  hypothetical protein  40.51 
 
 
414 aa  262  8e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1380  hypothetical protein  37.68 
 
 
447 aa  258  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369053  normal  0.0607438 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30770  hypothetical protein  37.35 
 
 
444 aa  235  8e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0090  Pyrrolo-quinoline quinone  42.93 
 
 
444 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21130  hypothetical protein  37 
 
 
493 aa  222  8e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4097  hypothetical protein  26.8 
 
 
412 aa  84  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4007  hypothetical protein  27.09 
 
 
402 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275688  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2473  hypothetical protein  24.5 
 
 
410 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2837  hypothetical protein  27.66 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2378  hypothetical protein  29.43 
 
 
394 aa  67  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.898929  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2445  hypothetical protein  25.08 
 
 
405 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1598  hypothetical protein  27.57 
 
 
408 aa  58.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4863  hypothetical protein  24.21 
 
 
402 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1421  hypothetical protein  24.59 
 
 
439 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2857  lipoprotein  25.38 
 
 
405 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0294  putative lipoprotein  30.3 
 
 
465 aa  43.1  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0347372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>