40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2378 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2378  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  753    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.898929  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4097  hypothetical protein  35.01 
 
 
412 aa  186  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4007  hypothetical protein  29.6 
 
 
402 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275688  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2473  hypothetical protein  31.16 
 
 
410 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2837  hypothetical protein  33.07 
 
 
383 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2445  hypothetical protein  27.17 
 
 
405 aa  137  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30770  hypothetical protein  30.42 
 
 
444 aa  133  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3560  putative secreted protein  33.24 
 
 
408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2434  hypothetical protein  32.13 
 
 
414 aa  126  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2871  hypothetical protein  28.3 
 
 
410 aa  126  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36800  hypothetical protein  30.87 
 
 
482 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0161837  normal  0.220338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0087  pyrrolo-quinoline quinone  33.62 
 
 
454 aa  124  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1901  putative lipoprotein  27.39 
 
 
432 aa  122  9e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380336  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1598  hypothetical protein  29.35 
 
 
408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4108  putative secreted protein  30.71 
 
 
455 aa  119  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1380  hypothetical protein  28.65 
 
 
447 aa  102  9e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369053  normal  0.0607438 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2855  hypothetical protein  29.7 
 
 
403 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3748  putative secreted protein  29.3 
 
 
434 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440402  hitchhiker  0.00438258 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1421  hypothetical protein  24.65 
 
 
439 aa  100  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0152  pyrrolo-quinoline quinone  30.43 
 
 
429 aa  96.7  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0563094 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1977  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.42 
 
 
451 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200738  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4863  hypothetical protein  26.09 
 
 
402 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2857  lipoprotein  28.1 
 
 
405 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21130  hypothetical protein  26.48 
 
 
493 aa  94  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6283  hypothetical protein  28.1 
 
 
411 aa  84  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0294  putative lipoprotein  22.84 
 
 
465 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0347372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1163  hypothetical protein  26.91 
 
 
400 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.340868  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3290  hypothetical protein  23.72 
 
 
404 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0090  Pyrrolo-quinoline quinone  30.11 
 
 
444 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1070  hypothetical protein  29.43 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5323  hypothetical protein  28.75 
 
 
397 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5107  hypothetical protein  28.3 
 
 
389 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129857  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4808  hypothetical protein  28.3 
 
 
389 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4722  hypothetical protein  28.3 
 
 
389 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347098  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1165  putative ABC transporter  27.94 
 
 
399 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.384071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6285  hypothetical protein  26.7 
 
 
379 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1072  hypothetical protein  30.47 
 
 
445 aa  57  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44347  predicted protein  26.5 
 
 
646 aa  50.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00207317  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5109  hypothetical protein  26.69 
 
 
407 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11867  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.71 
 
 
366 aa  43.9  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>