31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1163 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1163  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  790    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.340868  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2855  hypothetical protein  58.42 
 
 		 403 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6283  hypothetical protein  59.13 
 
 		 411 aa  451  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5323  hypothetical protein  57.48 
 
 		 397 aa  432  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36800  hypothetical protein  56.81 
 
 		 482 aa  421  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0161837  normal  0.220338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4722  hypothetical protein  57.65 
 
 		 389 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347098  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5107  hypothetical protein  57.65 
 
 		 389 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129857  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4808  hypothetical protein  57.65 
 
 		 389 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0152  pyrrolo-quinoline quinone  55.44 
 
 		 429 aa  398  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0563094 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0087  pyrrolo-quinoline quinone  58.76 
 
 		 454 aa  393  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4108  putative secreted protein  51.6 
 
 		 455 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3748  putative secreted protein  52.37 
 
 		 434 aa  358  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440402  hitchhiker  0.00438258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0090  Pyrrolo-quinoline quinone  57.88 
 
 		 444 aa  349  4e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1380  hypothetical protein  46.72 
 
 		 447 aa  343  2.9999999999999997e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369053  normal  0.0607438 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2434  hypothetical protein  47.18 
 
 		 414 aa  338  9e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3560  putative secreted protein  47.09 
 
 		 408 aa  324  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2871  hypothetical protein  43.47 
 
 		 410 aa  322  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1070  hypothetical protein  47.15 
 
 		 404 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30770  hypothetical protein  42.27 
 
 		 444 aa  281  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21130  hypothetical protein  43.21 
 
 		 493 aa  267  2e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4007  hypothetical protein  25.27 
 
 		 402 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275688  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4097  hypothetical protein  26.21 
 
 		 412 aa  97.4  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2473  hypothetical protein  24.58 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1598  hypothetical protein  26.3 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2445  hypothetical protein  23.69 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2837  hypothetical protein  24.64 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2378  hypothetical protein  26.63 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.898929  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0294  putative lipoprotein  26.56 
 
 		 465 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0347372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6285  hypothetical protein  27.13 
 
 		 379 aa  50.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1977  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.48 
 
 		 451 aa  50.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2857  lipoprotein  26.35 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>