38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30770 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_30770  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  880    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21130  hypothetical protein  53.56 
 
 		 493 aa  399  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36800  hypothetical protein  46.63 
 
 		 482 aa  354  1e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0161837  normal  0.220338 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0152  pyrrolo-quinoline quinone  45.77 
 
 		 429 aa  339  7e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0563094 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4108  putative secreted protein  46.28 
 
 		 455 aa  338  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0087  pyrrolo-quinoline quinone  44.81 
 
 		 454 aa  323  3e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2871  hypothetical protein  41.73 
 
 		 410 aa  303  6.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1380  hypothetical protein  40.69 
 
 		 447 aa  294  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369053  normal  0.0607438 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2855  hypothetical protein  42.9 
 
 		 403 aa  291  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2434  hypothetical protein  43.6 
 
 		 414 aa  284  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0090  Pyrrolo-quinoline quinone  45.24 
 
 		 444 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3560  putative secreted protein  43.53 
 
 		 408 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1163  hypothetical protein  42.27 
 
 		 400 aa  281  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.340868  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6283  hypothetical protein  42.66 
 
 		 411 aa  276  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3748  putative secreted protein  39.5 
 
 		 434 aa  266  5.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440402  hitchhiker  0.00438258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5107  hypothetical protein  40.05 
 
 		 389 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129857  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4808  hypothetical protein  40.05 
 
 		 389 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4722  hypothetical protein  40.05 
 
 		 389 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347098  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5323  hypothetical protein  38.59 
 
 		 397 aa  255  9e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1070  hypothetical protein  38.48 
 
 		 404 aa  225  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4097  hypothetical protein  27.96 
 
 		 412 aa  133  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4007  hypothetical protein  28.69 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275688  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2378  hypothetical protein  30.4 
 
 		 394 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.898929  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2473  hypothetical protein  27.57 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2445  hypothetical protein  23.73 
 
 		 405 aa  97.1  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2837  hypothetical protein  25.33 
 
 		 383 aa  89.7  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1598  hypothetical protein  26.44 
 
 		 408 aa  89.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2857  lipoprotein  27.49 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1977  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.56 
 
 		 451 aa  63.5  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0294  putative lipoprotein  27.11 
 
 		 465 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0347372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6285  hypothetical protein  25.48 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5109  hypothetical protein  26.51 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11867  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1901  putative lipoprotein  40.32 
 
 		 432 aa  50.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380336  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1165  putative ABC transporter  30.37 
 
 		 399 aa  50.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.384071 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1421  hypothetical protein  21.62 
 
 		 439 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44347  predicted protein  29.89 
 
 		 646 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00207317  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4863  hypothetical protein  26.43 
 
 		 402 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1072  hypothetical protein  30.88 
 
 		 445 aa  43.1  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>