19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1072 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1072  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  857    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2857  lipoprotein  39.52 
 
 		 405 aa  189  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1165  putative ABC transporter  34.46 
 
 		 399 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.384071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6285  hypothetical protein  33.41 
 
 		 379 aa  150  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5109  hypothetical protein  36.05 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11867  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5325  ABC-3 protein  32.15 
 
 		 664 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4724  putative ABC transporter  36.36 
 
 		 254 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4810  putative ABC transporter  36.36 
 
 		 257 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.582677 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0087  pyrrolo-quinoline quinone  34.8 
 
 		 454 aa  75.5  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0090  Pyrrolo-quinoline quinone  36.81 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1380  hypothetical protein  30 
 
 		 447 aa  56.6  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369053  normal  0.0607438 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2434  hypothetical protein  33.33 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1901  putative lipoprotein  23.62 
 
 		 432 aa  53.1  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380336  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3748  putative secreted protein  29.94 
 
 		 434 aa  50.8  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440402  hitchhiker  0.00438258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3560  putative secreted protein  25.59 
 
 		 408 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2871  hypothetical protein  26.49 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0152  pyrrolo-quinoline quinone  30.48 
 
 		 429 aa  48.5  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0563094 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36800  hypothetical protein  29.26 
 
 		 482 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0161837  normal  0.220338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2378  hypothetical protein  30.7 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.898929  normal  0.0133662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>