37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2857 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2857  lipoprotein  100 
 
 
405 aa  790    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1165  putative ABC transporter  38.32 
 
 
399 aa  202  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.384071 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1072  hypothetical protein  39.25 
 
 
445 aa  189  9e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6285  hypothetical protein  34.74 
 
 
379 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5109  hypothetical protein  36.54 
 
 
407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11867  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5325  ABC-3 protein  35.12 
 
 
664 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4724  putative ABC transporter  36 
 
 
254 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4810  putative ABC transporter  36 
 
 
257 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.582677 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4108  putative secreted protein  30.06 
 
 
455 aa  96.7  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0087  pyrrolo-quinoline quinone  29.41 
 
 
454 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0152  pyrrolo-quinoline quinone  28.81 
 
 
429 aa  94  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0563094 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3560  putative secreted protein  30.21 
 
 
408 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36800  hypothetical protein  28.34 
 
 
482 aa  88.2  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0161837  normal  0.220338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2378  hypothetical protein  28.97 
 
 
394 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.898929  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2434  hypothetical protein  28.8 
 
 
414 aa  87.4  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1380  hypothetical protein  26.18 
 
 
447 aa  86.7  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369053  normal  0.0607438 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3748  putative secreted protein  25.29 
 
 
434 aa  84.7  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440402  hitchhiker  0.00438258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2871  hypothetical protein  24.09 
 
 
410 aa  83.2  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2855  hypothetical protein  27.54 
 
 
403 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0090  Pyrrolo-quinoline quinone  30.23 
 
 
444 aa  77.4  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30770  hypothetical protein  28.1 
 
 
444 aa  73.9  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4007  hypothetical protein  25.57 
 
 
402 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275688  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2473  hypothetical protein  24.84 
 
 
410 aa  65.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5323  hypothetical protein  26.84 
 
 
397 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21130  hypothetical protein  23.95 
 
 
493 aa  58.9  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2837  hypothetical protein  26.83 
 
 
383 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5107  hypothetical protein  25.3 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129857  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4722  hypothetical protein  25.3 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347098  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4808  hypothetical protein  25.3 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1163  hypothetical protein  27.07 
 
 
400 aa  53.5  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.340868  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1421  hypothetical protein  24.08 
 
 
439 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1070  hypothetical protein  26.59 
 
 
404 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1977  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.61 
 
 
451 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200738  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6283  hypothetical protein  24.37 
 
 
411 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2445  hypothetical protein  21.59 
 
 
405 aa  50.8  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4097  hypothetical protein  25.39 
 
 
412 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1901  putative lipoprotein  22.81 
 
 
432 aa  43.1  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>