39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2871 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2871  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  836    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3560  putative secreted protein  64.99 
 
 		 408 aa  510  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36800  hypothetical protein  51.72 
 
 		 482 aa  404  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0161837  normal  0.220338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0087  pyrrolo-quinoline quinone  51.9 
 
 		 454 aa  403  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1380  hypothetical protein  49.02 
 
 		 447 aa  394  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369053  normal  0.0607438 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0152  pyrrolo-quinoline quinone  50.66 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0563094 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2434  hypothetical protein  49.23 
 
 		 414 aa  388  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4108  putative secreted protein  50.89 
 
 		 455 aa  376  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2855  hypothetical protein  49.26 
 
 		 403 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3748  putative secreted protein  47.63 
 
 		 434 aa  360  4e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440402  hitchhiker  0.00438258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0090  Pyrrolo-quinoline quinone  53.95 
 
 		 444 aa  358  9.999999999999999e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5323  hypothetical protein  46.14 
 
 		 397 aa  348  7e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6283  hypothetical protein  44.14 
 
 		 411 aa  325  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1163  hypothetical protein  43.72 
 
 		 400 aa  325  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.340868  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5107  hypothetical protein  44.74 
 
 		 389 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129857  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4722  hypothetical protein  44.74 
 
 		 389 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347098  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4808  hypothetical protein  44.74 
 
 		 389 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30770  hypothetical protein  41.73 
 
 		 444 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21130  hypothetical protein  42.36 
 
 		 493 aa  287  2.9999999999999996e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1070  hypothetical protein  40.05 
 
 		 404 aa  259  6e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4097  hypothetical protein  25.91 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4007  hypothetical protein  26.36 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275688  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2378  hypothetical protein  28.73 
 
 		 394 aa  109  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.898929  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2473  hypothetical protein  25.46 
 
 		 410 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1977  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.35 
 
 		 451 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2837  hypothetical protein  24.2 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0294  putative lipoprotein  24.38 
 
 		 465 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0347372  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1598  hypothetical protein  26.22 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1901  putative lipoprotein  24.64 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380336  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2857  lipoprotein  24.05 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2445  hypothetical protein  22.49 
 
 		 405 aa  67  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6285  hypothetical protein  25.31 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1421  hypothetical protein  22.83 
 
 		 439 aa  53.5  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4863  hypothetical protein  25.44 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5109  hypothetical protein  23.03 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11867  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1072  hypothetical protein  26.49 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3290  hypothetical protein  27.85 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1165  putative ABC transporter  27.75 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.384071 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44347  predicted protein  30.13 
 
 		 646 aa  43.5  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00207317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>