36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1380 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1380  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  901    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369053  normal  0.0607438 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0087  pyrrolo-quinoline quinone  55.41 
 
 		 454 aa  432  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36800  hypothetical protein  51.1 
 
 		 482 aa  416  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0161837  normal  0.220338 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0152  pyrrolo-quinoline quinone  53.21 
 
 		 429 aa  412  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0563094 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3748  putative secreted protein  51.14 
 
 		 434 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440402  hitchhiker  0.00438258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0090  Pyrrolo-quinoline quinone  58.2 
 
 		 444 aa  388  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2871  hypothetical protein  48.53 
 
 		 410 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2434  hypothetical protein  51.27 
 
 		 414 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4108  putative secreted protein  48.44 
 
 		 455 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2855  hypothetical protein  51.67 
 
 		 403 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3560  putative secreted protein  48.27 
 
 		 408 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1163  hypothetical protein  46.72 
 
 		 400 aa  343  4e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.340868  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21130  hypothetical protein  42.42 
 
 		 493 aa  294  2e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30770  hypothetical protein  40.69 
 
 		 444 aa  294  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5323  hypothetical protein  41.09 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6283  hypothetical protein  42.86 
 
 		 411 aa  282  9e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4722  hypothetical protein  41.24 
 
 		 389 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347098  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5107  hypothetical protein  41.24 
 
 		 389 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129857  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4808  hypothetical protein  41.24 
 
 		 389 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1070  hypothetical protein  38.73 
 
 		 404 aa  252  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4097  hypothetical protein  28.1 
 
 		 412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4007  hypothetical protein  27.87 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275688  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2473  hypothetical protein  27.41 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1598  hypothetical protein  26.13 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2837  hypothetical protein  23.88 
 
 		 383 aa  94.7  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2445  hypothetical protein  25.53 
 
 		 405 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2378  hypothetical protein  28.65 
 
 		 394 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.898929  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2857  lipoprotein  26.18 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0294  putative lipoprotein  25.47 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0347372  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1977  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  26.4 
 
 		 451 aa  66.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1901  putative lipoprotein  22.68 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380336  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1072  hypothetical protein  29.32 
 
 		 445 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1421  hypothetical protein  21.57 
 
 		 439 aa  45.8  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1165  putative ABC transporter  25 
 
 		 399 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.384071 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5109  hypothetical protein  23.44 
 
 		 407 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11867  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3290  hypothetical protein  28.4 
 
 		 404 aa  43.9  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>