21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3290 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3290  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  821    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4863  hypothetical protein  53.22 
 
 
402 aa  442  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2837  hypothetical protein  27.17 
 
 
383 aa  95.1  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4007  hypothetical protein  23.41 
 
 
402 aa  81.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275688  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1901  putative lipoprotein  24.58 
 
 
432 aa  79.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380336  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1977  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  23.34 
 
 
451 aa  75.1  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200738  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2445  hypothetical protein  23.39 
 
 
405 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1598  hypothetical protein  23.83 
 
 
408 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0294  putative lipoprotein  23.34 
 
 
465 aa  61.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0347372  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4097  hypothetical protein  20.67 
 
 
412 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2473  hypothetical protein  22.05 
 
 
410 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1421  hypothetical protein  23.53 
 
 
439 aa  56.6  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2378  hypothetical protein  23.42 
 
 
394 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.898929  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36800  hypothetical protein  22.63 
 
 
482 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0161837  normal  0.220338 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2434  hypothetical protein  22.85 
 
 
414 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6283  hypothetical protein  23.46 
 
 
411 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2871  hypothetical protein  27.85 
 
 
410 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0152  pyrrolo-quinoline quinone  21.31 
 
 
429 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0563094 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1380  hypothetical protein  28.4 
 
 
447 aa  43.9  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369053  normal  0.0607438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1070  hypothetical protein  21.45 
 
 
404 aa  43.1  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2855  hypothetical protein  28.15 
 
 
403 aa  42.7  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>