39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2837 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2837  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  772    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4007  hypothetical protein  29.53 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275688  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4097  hypothetical protein  28.53 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1901  putative lipoprotein  29.82 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380336  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2473  hypothetical protein  28.12 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2378  hypothetical protein  32.23 
 
 		 394 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.898929  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1598  hypothetical protein  29.41 
 
 		 408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2445  hypothetical protein  25.53 
 
 		 405 aa  125  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1977  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.3 
 
 		 451 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0294  putative lipoprotein  24.2 
 
 		 465 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0347372  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0087  pyrrolo-quinoline quinone  25.7 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1421  hypothetical protein  28.05 
 
 		 439 aa  99  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1380  hypothetical protein  24.44 
 
 		 447 aa  97.4  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369053  normal  0.0607438 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3290  hypothetical protein  27.17 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36800  hypothetical protein  24.8 
 
 		 482 aa  91.3  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0161837  normal  0.220338 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30770  hypothetical protein  25.33 
 
 		 444 aa  90.1  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3748  putative secreted protein  24.93 
 
 		 434 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440402  hitchhiker  0.00438258 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0152  pyrrolo-quinoline quinone  25.28 
 
 		 429 aa  87.8  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0563094 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2434  hypothetical protein  26.91 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2871  hypothetical protein  24.49 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1163  hypothetical protein  25 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.340868  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1070  hypothetical protein  28.52 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3560  putative secreted protein  27.62 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4863  hypothetical protein  27.91 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21130  hypothetical protein  25.78 
 
 		 493 aa  71.2  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4722  hypothetical protein  28.14 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347098  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4808  hypothetical protein  28.14 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5107  hypothetical protein  28.14 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129857  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5109  hypothetical protein  27.4 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11867  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4108  putative secreted protein  22.97 
 
 		 455 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6283  hypothetical protein  24.72 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0090  Pyrrolo-quinoline quinone  23.81 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2855  hypothetical protein  23.92 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5323  hypothetical protein  22.14 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4724  putative ABC transporter  26.72 
 
 		 254 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4810  putative ABC transporter  26.72 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.582677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6285  hypothetical protein  23.21 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2857  lipoprotein  26.05 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1165  putative ABC transporter  26.3 
 
 		 399 aa  43.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.384071 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>