14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4810 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_4810  putative ABC transporter  100 
 
 
257 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.582677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5109  hypothetical protein  99.61 
 
 
407 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11867  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4724  putative ABC transporter  99.61 
 
 
254 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260926  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5325  ABC-3 protein  59.22 
 
 
664 aa  268  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6285  hypothetical protein  39.83 
 
 
379 aa  135  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1165  putative ABC transporter  37.66 
 
 
399 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.384071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2857  lipoprotein  41.28 
 
 
405 aa  112  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1072  hypothetical protein  35.89 
 
 
445 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36800  hypothetical protein  25.88 
 
 
482 aa  46.2  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0161837  normal  0.220338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4722  hypothetical protein  25 
 
 
389 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347098  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4808  hypothetical protein  25 
 
 
389 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5107  hypothetical protein  25 
 
 
389 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129857  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6283  hypothetical protein  24.29 
 
 
411 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4108  putative secreted protein  26.4 
 
 
455 aa  42  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>