35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1977 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1977  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  100 
 
 		 451 aa  928    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0294  putative lipoprotein  48.82 
 
 		 465 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0347372  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1901  putative lipoprotein  35.94 
 
 		 432 aa  272  8.000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380336  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2837  hypothetical protein  25.3 
 
 		 383 aa  113  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36800  hypothetical protein  27.18 
 
 		 482 aa  88.6  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0161837  normal  0.220338 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4108  putative secreted protein  27.4 
 
 		 455 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2871  hypothetical protein  26.61 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2473  hypothetical protein  24.47 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1421  hypothetical protein  25.4 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4863  hypothetical protein  23.1 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2378  hypothetical protein  25.56 
 
 		 394 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.898929  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3290  hypothetical protein  23.34 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4007  hypothetical protein  23.23 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275688  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2434  hypothetical protein  26.14 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0087  pyrrolo-quinoline quinone  24.56 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3560  putative secreted protein  25.62 
 
 		 408 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1380  hypothetical protein  26.4 
 
 		 447 aa  66.2  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369053  normal  0.0607438 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0152  pyrrolo-quinoline quinone  23.61 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0563094 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30770  hypothetical protein  25.56 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4097  hypothetical protein  24.55 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2855  hypothetical protein  25.14 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3748  putative secreted protein  24.58 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440402  hitchhiker  0.00438258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5107  hypothetical protein  26.89 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129857  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4808  hypothetical protein  26.89 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4722  hypothetical protein  26.89 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347098  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6283  hypothetical protein  25.3 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44347  predicted protein  23.92 
 
 		 646 aa  56.6  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00207317  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6285  hypothetical protein  23.43 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21130  hypothetical protein  25.63 
 
 		 493 aa  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1163  hypothetical protein  25.48 
 
 		 400 aa  50.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.340868  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1598  hypothetical protein  25.45 
 
 		 408 aa  50.1  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5323  hypothetical protein  25.68 
 
 		 397 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2857  lipoprotein  56.1 
 
 		 405 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0090  Pyrrolo-quinoline quinone  23.28 
 
 		 444 aa  47.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2445  hypothetical protein  24.04 
 
 		 405 aa  47  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>