34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2445 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2445  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  836    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1598  hypothetical protein  60.78 
 
 
408 aa  517  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4097  hypothetical protein  42.13 
 
 
412 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2473  hypothetical protein  41.23 
 
 
410 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4007  hypothetical protein  37.13 
 
 
402 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275688  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2378  hypothetical protein  27.17 
 
 
394 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.898929  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2837  hypothetical protein  25.53 
 
 
383 aa  113  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30770  hypothetical protein  23.73 
 
 
444 aa  96.7  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36800  hypothetical protein  25.21 
 
 
482 aa  96.3  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0161837  normal  0.220338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0087  pyrrolo-quinoline quinone  24.36 
 
 
454 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1380  hypothetical protein  25.53 
 
 
447 aa  91.3  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369053  normal  0.0607438 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4863  hypothetical protein  23.92 
 
 
402 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0152  pyrrolo-quinoline quinone  23.68 
 
 
429 aa  87.4  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0563094 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2855  hypothetical protein  24.84 
 
 
403 aa  83.2  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3560  putative secreted protein  25.99 
 
 
408 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1163  hypothetical protein  23.69 
 
 
400 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.340868  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2434  hypothetical protein  23.37 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3748  putative secreted protein  24.84 
 
 
434 aa  74.7  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440402  hitchhiker  0.00438258 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1901  putative lipoprotein  26.47 
 
 
432 aa  73.9  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380336  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1421  hypothetical protein  21.54 
 
 
439 aa  73.2  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5107  hypothetical protein  25.75 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129857  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4808  hypothetical protein  25.75 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4722  hypothetical protein  25.75 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3290  hypothetical protein  23.17 
 
 
404 aa  70.5  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4108  putative secreted protein  24.1 
 
 
455 aa  69.7  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5323  hypothetical protein  23.73 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2871  hypothetical protein  22.8 
 
 
410 aa  67  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0294  putative lipoprotein  24.91 
 
 
465 aa  66.6  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0347372  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21130  hypothetical protein  23.18 
 
 
493 aa  62  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1070  hypothetical protein  25.08 
 
 
404 aa  60.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0090  Pyrrolo-quinoline quinone  24.06 
 
 
444 aa  56.2  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6283  hypothetical protein  21.9 
 
 
411 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1977  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  24.04 
 
 
451 aa  47.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200738  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44347  predicted protein  22.53 
 
 
646 aa  46.6  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00207317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>