39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0087 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0087  pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 454 aa  883    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36800  hypothetical protein  65.01 
 
 		 482 aa  509  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0161837  normal  0.220338 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0152  pyrrolo-quinoline quinone  68.09 
 
 		 429 aa  509  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0563094 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0090  Pyrrolo-quinoline quinone  70.35 
 
 		 444 aa  455  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3748  putative secreted protein  58.04 
 
 		 434 aa  441  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440402  hitchhiker  0.00438258 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1380  hypothetical protein  52.57 
 
 		 447 aa  437  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369053  normal  0.0607438 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1163  hypothetical protein  55.58 
 
 		 400 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.340868  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4108  putative secreted protein  55.39 
 
 		 455 aa  405  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2871  hypothetical protein  50.36 
 
 		 410 aa  398  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2855  hypothetical protein  53.07 
 
 		 403 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3560  putative secreted protein  57.77 
 
 		 408 aa  391  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2434  hypothetical protein  51.9 
 
 		 414 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6283  hypothetical protein  49.72 
 
 		 411 aa  350  3e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5323  hypothetical protein  48 
 
 		 397 aa  342  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4808  hypothetical protein  50.26 
 
 		 389 aa  333  4e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5107  hypothetical protein  50.26 
 
 		 389 aa  333  4e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129857  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4722  hypothetical protein  50.26 
 
 		 389 aa  333  4e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347098  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30770  hypothetical protein  45 
 
 		 444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21130  hypothetical protein  44.15 
 
 		 493 aa  301  1e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1070  hypothetical protein  43.6 
 
 		 404 aa  283  5.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4007  hypothetical protein  30.36 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275688  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4097  hypothetical protein  28.12 
 
 		 412 aa  118  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2378  hypothetical protein  31.96 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.898929  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2473  hypothetical protein  25.07 
 
 		 410 aa  109  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2837  hypothetical protein  25.7 
 
 		 383 aa  100  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2445  hypothetical protein  24.36 
 
 		 405 aa  91.7  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2857  lipoprotein  28.77 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1598  hypothetical protein  25.91 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1072  hypothetical protein  34.8 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0294  putative lipoprotein  28.7 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0347372  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1977  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  24.03 
 
 		 451 aa  70.9  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5109  hypothetical protein  26.98 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11867  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1165  putative ABC transporter  29.17 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.384071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6285  hypothetical protein  26.5 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1901  putative lipoprotein  24.73 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380336  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4863  hypothetical protein  23.56 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5325  ABC-3 protein  32.76 
 
 		 664 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1421  hypothetical protein  20.05 
 
 		 439 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  31.25 
 
 		 899 aa  43.9  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>