36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3560 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3560  putative secreted protein  100 
 
 
408 aa  808    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2871  hypothetical protein  63.95 
 
 
410 aa  523  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0087  pyrrolo-quinoline quinone  56.15 
 
 
454 aa  405  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36800  hypothetical protein  51.05 
 
 
482 aa  385  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0161837  normal  0.220338 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0152  pyrrolo-quinoline quinone  53.4 
 
 
429 aa  382  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0563094 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1380  hypothetical protein  47.91 
 
 
447 aa  375  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369053  normal  0.0607438 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2434  hypothetical protein  49.36 
 
 
414 aa  362  5.0000000000000005e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2855  hypothetical protein  49.02 
 
 
403 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3748  putative secreted protein  50 
 
 
434 aa  352  8e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440402  hitchhiker  0.00438258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4108  putative secreted protein  49.59 
 
 
455 aa  348  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0090  Pyrrolo-quinoline quinone  54.08 
 
 
444 aa  338  9e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1163  hypothetical protein  47.26 
 
 
400 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.340868  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5107  hypothetical protein  49.03 
 
 
389 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129857  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4808  hypothetical protein  49.03 
 
 
389 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4722  hypothetical protein  49.03 
 
 
389 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347098  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5323  hypothetical protein  44.55 
 
 
397 aa  316  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6283  hypothetical protein  44.12 
 
 
411 aa  312  7.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30770  hypothetical protein  43.03 
 
 
444 aa  296  3e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21130  hypothetical protein  41.44 
 
 
493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1070  hypothetical protein  40.53 
 
 
404 aa  262  8.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2378  hypothetical protein  33.62 
 
 
394 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.898929  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4097  hypothetical protein  30.61 
 
 
412 aa  117  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4007  hypothetical protein  28.44 
 
 
402 aa  113  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275688  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1598  hypothetical protein  29.17 
 
 
408 aa  98.6  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2473  hypothetical protein  27.61 
 
 
410 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2857  lipoprotein  29.39 
 
 
405 aa  94  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2445  hypothetical protein  25.99 
 
 
405 aa  89.7  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2837  hypothetical protein  26.69 
 
 
383 aa  76.3  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0294  putative lipoprotein  30.63 
 
 
465 aa  76.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0347372  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1901  putative lipoprotein  25.35 
 
 
432 aa  72.8  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380336  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1977  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.65 
 
 
451 aa  70.9  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5109  hypothetical protein  26.6 
 
 
407 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11867  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6285  hypothetical protein  23.4 
 
 
379 aa  53.5  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1072  hypothetical protein  28.51 
 
 
445 aa  50.8  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1421  hypothetical protein  23.66 
 
 
439 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1165  putative ABC transporter  28.26 
 
 
399 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.384071 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>