35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4097 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4097  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  827    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4007  hypothetical protein  48.52 
 
 		 402 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275688  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1598  hypothetical protein  46.81 
 
 		 408 aa  345  6e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2473  hypothetical protein  45.57 
 
 		 410 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2445  hypothetical protein  43.92 
 
 		 405 aa  334  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2378  hypothetical protein  35.58 
 
 		 394 aa  160  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.898929  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2837  hypothetical protein  27.93 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30770  hypothetical protein  27.96 
 
 		 444 aa  133  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1380  hypothetical protein  28.1 
 
 		 447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369053  normal  0.0607438 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36800  hypothetical protein  26.42 
 
 		 482 aa  126  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0161837  normal  0.220338 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0152  pyrrolo-quinoline quinone  29.28 
 
 		 429 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0563094 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2871  hypothetical protein  25.91 
 
 		 410 aa  119  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0087  pyrrolo-quinoline quinone  28.12 
 
 		 454 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3560  putative secreted protein  30.03 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2434  hypothetical protein  26.97 
 
 		 414 aa  108  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2855  hypothetical protein  26.42 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3748  putative secreted protein  25.99 
 
 		 434 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440402  hitchhiker  0.00438258 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21130  hypothetical protein  25.26 
 
 		 493 aa  98.2  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1163  hypothetical protein  26.21 
 
 		 400 aa  97.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.340868  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6283  hypothetical protein  27.74 
 
 		 411 aa  93.2  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4863  hypothetical protein  25.68 
 
 		 402 aa  92.8  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4108  putative secreted protein  24.86 
 
 		 455 aa  90.9  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4722  hypothetical protein  29.45 
 
 		 389 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347098  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5107  hypothetical protein  29.45 
 
 		 389 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129857  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4808  hypothetical protein  29.45 
 
 		 389 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.197598  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1421  hypothetical protein  23.22 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5323  hypothetical protein  26.37 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0090  Pyrrolo-quinoline quinone  26.76 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1070  hypothetical protein  26.8 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0294  putative lipoprotein  24.4 
 
 		 465 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0347372  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1901  putative lipoprotein  24.67 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380336  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44347  predicted protein  28.69 
 
 		 646 aa  63.2  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00207317  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1977  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  24.55 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3290  hypothetical protein  20.67 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1165  putative ABC transporter  26.38 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.384071 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>