75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0662 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0524  major facilitator family transporter  89.97 
 
 		 388 aa  680    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3461  major facilitator transporter  98.47 
 
 		 391 aa  770    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0662  major facilitator transporter  100 
 
 		 391 aa  779    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3285  major facilitator transporter  98.47 
 
 		 391 aa  766    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3168  major facilitator transporter  79.69 
 
 		 390 aa  631  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0940  major facilitator family transporter  72.31 
 
 		 398 aa  580  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0814  transporter protein, putative  24.26 
 
 		 475 aa  72  0.00000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.591917  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1006  hypothetical protein  31.67 
 
 		 136 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3982  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 409 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2860  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.085124 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3546  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 409 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.460854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1170  major facilitator transporter  25 
 
 		 408 aa  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 409 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0675  hypothetical protein  25.16 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1399  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0692  hypothetical protein  25.16 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1383  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  32.99 
 
 		 468 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1310  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 401 aa  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0992483  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1422  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33078  putative xylose transporter  24.92 
 
 		 495 aa  47.4  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2955  major facilitator superfamily MFS_1  24.6 
 
 		 401 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 441 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 460 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  29.94 
 
 		 480 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  29.41 
 
 		 426 aa  47  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3891  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 404 aa  47  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  31.52 
 
 		 464 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  46.6  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  31.52 
 
 		 464 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  31.52 
 
 		 464 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  47  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 443 aa  47  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  31.52 
 
 		 464 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3599  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00583195  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  30.85 
 
 		 465 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 441 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.83 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  21.32 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  26.11 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1642  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.3142  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0926  putative hexuronate transporter  27.1 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  29.5 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0978  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3361  putative hexuronate transporter  27.1 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  28.38 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  28.34 
 
 		 426 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  28.34 
 
 		 426 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 518 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 449 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  25.62 
 
 		 423 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1829  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 388 aa  44.3  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  30.4 
 
 		 441 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  24.08 
 
 		 445 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  27.7 
 
 		 439 aa  43.9  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.46 
 
 		 536 aa  43.5  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 400 aa  43.5  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  22.63 
 
 		 427 aa  43.5  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  24.87 
 
 		 414 aa  43.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 434 aa  42.7  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>