76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3461 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0524  major facilitator family transporter  90.23 
 
 		 388 aa  681    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3461  major facilitator transporter  100 
 
 		 391 aa  778    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0662  major facilitator transporter  98.47 
 
 		 391 aa  770    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3285  major facilitator transporter  98.21 
 
 		 391 aa  764    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3168  major facilitator transporter  80.46 
 
 		 390 aa  634  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0940  major facilitator family transporter  71.54 
 
 		 398 aa  575  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0814  transporter protein, putative  24.51 
 
 		 475 aa  75.1  0.000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.591917  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1006  hypothetical protein  32.5 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3982  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2860  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.085124 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1383  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0692  hypothetical protein  25.16 
 
 		 427 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3891  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 404 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1310  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0992483  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1399  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  32.99 
 
 		 468 aa  47.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0675  hypothetical protein  25.16 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 441 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3546  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.460854 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 421 aa  47.4  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3599  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 435 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00583195  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 		 423 aa  47  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 409 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  26.34 
 
 		 423 aa  46.6  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 460 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  31.52 
 
 		 464 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1422  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 401 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  31.52 
 
 		 464 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0978  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 435 aa  46.2  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3361  putative hexuronate transporter  27.74 
 
 		 435 aa  46.2  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  46.6  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0926  putative hexuronate transporter  27.74 
 
 		 435 aa  46.2  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  31.52 
 
 		 464 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  31.52 
 
 		 464 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1170  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  30.85 
 
 		 465 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2955  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  29.5 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  25.85 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.83 
 
 		 460 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1829  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  29.41 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  28.81 
 
 		 480 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 441 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.32 
 
 		 536 aa  44.3  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 446 aa  43.9  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0313  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.02 
 
 		 531 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00303369  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 400 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07119  conserved hypothetical protein  40.32 
 
 		 619 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.740626 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 445 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  29.6 
 
 		 466 aa  43.5  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  38.75 
 
 		 475 aa  43.5  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5588  putative multidrug resistance protein, emrB-like protein  29.91 
 
 		 525 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339055  normal  0.392852 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  28.38 
 
 		 439 aa  43.5  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  26.89 
 
 		 465 aa  43.5  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  28.34 
 
 		 426 aa  43.1  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  23.36 
 
 		 427 aa  43.1  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33078  putative xylose transporter  23.3 
 
 		 495 aa  43.1  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  30.43 
 
 		 388 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4044  putative permease  30 
 
 		 420 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 424 aa  42.7  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  30.24 
 
 		 441 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>